在男方起诉离婚期间，是否可以让女方不继续共同居住，并没有绝对的法律规定，而是需要根据具体情况及双方的意愿来决定。以下是对此问题的详细分析：

一、双方协商一致的情况

1. 自由选择居住方式：如果夫妻双方能够协商一致，无论是选择继续共同居住还是分开居住，只要不违反法律法规和公序良俗，都是合法的。这意味着，如果男方和女方都同意在起诉离婚期间分开居住，那么这是完全可行的。

2. 考虑多种因素：共同居住或分开居住的决策可能基于多种因素，如照顾孩子、经济压力、情感依赖等。双方应充分沟通，确保决策符合双方利益，并尽量减少对彼此及家庭的影响。

二、存在特殊情况需分开居住

1. 家庭暴力等侵害行为：若男方存在家庭暴力、虐待、严重骚扰等可能对女方造成威胁的行为，女方有权申请保护性措施。根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，法院可根据申请采取保护性措施，如禁止男方接近或共同居住，甚至颁发人身安全保护令，以确保女方的人身安全。

2. 一方强烈要求且有合理理由：如男方认为继续共同居住会对生活、工作、心理等造成严重不利影响，并有合理理由支持，法院可能会支持其要求女方搬离的请求。但这种情况需要男方提供充分的证据来证明其主张的合理性。

三、法律影响分析

1. 财产分割：如果双方选择继续共同居住，财产收支可能难以区分，导致财产分割更加复杂。特别是在购买房屋等大额财产时，需谨慎处理，以免在离婚时被视为共同财产进行分割。

2. 子女抚养权：共同居住期间的相处情况可能影响子女抚养权的归属。如果男方存在不当行为，如忽视子女、对子女进行不良影响等，可能对其在抚养权争夺中不利。

3. 感情破裂证明：若长期共同居住，可能会被视为夫妻感情并未完全破裂，对离婚诉讼产生阻碍。因此，如果男方希望尽快离婚，可能需要考虑分开居住以证明感情已经破裂。

四、建议与注意事项

1. 充分沟通：在决定是否共同居住时，双方应充分沟通，并考虑到潜在的法律影响。尽量通过协商达成一致意见，以减少矛盾和纠纷。

2. 透明管理：如果决定共同居住，建议在财产管理、子女抚养等方面保持透明和沟通。记录重要支出和决策，以避免后续纠纷。

3. 保护自身权益：面对家庭暴力等特殊情况，女方应勇敢站出来，利用法律武器保护自己。及时收集证据并申请保护性措施，确保自身安全。

4. 寻求法律帮助：在起诉离婚期间，如果双方对居住问题存在争议或无法达成一致意见，建议及时向我咨询以获取专业的法律建议和支持。

综上所述，男方在起诉离婚期间是否可以让女方不继续共同居住，取决于双方的具体情况和意愿。在处理此类问题时，应充分考虑法律影响并保护自身权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。