法人与法人之间的合同纠纷是可以申请人民调解的。以下从多个角度为你详细分析：

法律依据角度

根据《中华人民共和国人民调解法》的相关规定，人民调解委员会可以调解民间纠纷，这里的民间纠纷涵盖了公民与公民之间、公民与法人和其他组织之间以及法人和其他组织之间涉及民事权利义务争议的各种纠纷。法人与法人之间的合同纠纷，本质上属于平等民事主体之间因合同履行、解释等产生的民事权利义务争议，完全符合人民调解的受理范围。例如，两家公司因为货物买卖合同的付款问题产生争议，双方就可以向人民调解委员会申请调解。

调解优势角度

1. 灵活便捷：人民调解不拘泥于严格的诉讼程序，调解的时间、地点、方式都可以由双方当事人和调解员根据实际情况灵活确定。这对于法人来说，可以减少因参与诉讼而耗费的大量时间和精力，不影响正常的经营活动。比如，双方可以选择在业务往来较为方便的地点进行调解，调解时间也可以根据双方的工作安排来确定。
2. 成本较低：与诉讼相比，人民调解不需要支付高额的诉讼费用、律师费用等。对于法人来说，尤其是中小企业，可以有效降低解决纠纷的成本。例如，一场诉讼可能需要支付数万元甚至数十万元的诉讼费用和律师费用，而人民调解可能只需要支付少量的调解费用或者甚至免费。
3. 保密性强：人民调解过程一般不公开进行，调解协议的内容也不对外公布。这对于法人来说，可以保护其商业秘密和商业信誉。比如，两家公司之间的合同纠纷可能涉及到一些敏感的商业信息，如果通过诉讼解决，这些信息可能会在庭审过程中被公开，而人民调解则可以避免这种情况的发生。
4. 维护合作关系：通过人民调解解决纠纷，双方可以在调解员的引导下，充分沟通、协商，寻求互利共赢的解决方案。这有助于维护双方之间的合作关系，避免因诉讼而导致关系破裂。例如，两家长期合作的公司因为合同纠纷闹上法庭，可能会影响未来的合作，而通过人民调解，双方可以化解矛盾，继续保持良好的合作关系。

调解程序角度

1. 申请调解：纠纷发生后，双方当事人可以共同向人民调解委员会提出调解申请，也可以一方当事人申请，另一方当事人同意调解的，也可以进行调解。申请调解时，可以口头申请，也可以书面申请。
2. 受理调解：人民调解委员会收到调解申请后，会对纠纷进行审查，认为符合受理条件的，会予以受理，并通知双方当事人。
3. 开展调解：调解员会根据纠纷的具体情况，采取适当的方式进行调解，如面对面调解、背靠背调解等。在调解过程中，调解员会听取双方当事人的陈述和意见，查明事实，分清责任，引导双方当事人达成调解协议。
4. 达成协议：如果双方当事人在调解员的引导下达成一致意见，会签订调解协议。调解协议具有法律约束力，双方当事人应当按照约定履行。
5. 司法确认（可选）：如果双方当事人担心调解协议的履行问题，可以向人民法院申请司法确认。经人民法院确认有效的调解协议，一方当事人拒绝履行或者未全部履行的，对方当事人可以向人民法院申请强制执行。

建议：如果法人与法人之间发生合同纠纷，双方可以先考虑通过人民调解的方式解决。在申请调解前，双方可以收集好相关的证据材料，如合同文本、付款凭证、沟通记录等，以便在调解过程中更好地维护自己的权益。如果在调解过程中遇到问题或者对调解结果不满意，也可以随时向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。