面对老板克扣学生工资的情况，学生应首先明确自己的身份及所处的法律关系，然后根据实际情况采取合适的措施来维护自己的合法权益。以下是具体的分析和建议：

1. 明确身份及法律关系

   • 在校学生勤工助学：如果你是在校学生，利用课余时间进行勤工助学，那么你与老板之间通常不视为建立了劳动关系，可以不签订劳动合同。但即便如此，你仍有权要求老板按照约定支付你应得的工资。
   • 已毕业学生：如果你已经毕业，并以就业为目的在公司工作，那么即使你处于试用期，也与老板建立了劳动关系，受《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的保护。

2. 与公司沟通协商

   • 收集证据：在协商之前，务必收集好所有能证明你与公司存在劳动关系以及老板克扣工资的证据，如工作证、考勤记录、工资条、银行转账记录、工作聊天记录、电子邮件等。
   • 友好协商：与公司的人力资源部门或直接上级进行沟通，说明情况，要求老板给出合理解释并补足工资。在协商过程中，可以面谈并录音，或者通过发邮件等方式留存记录，以备后续维权使用。
   • 查看规章制度：如果老板扣工资的依据是公司的相关规章制度，那么你有权要求查看这些规章制度是否经过事前公开公示。如果没有公示，那么这些规章制度不能作为克扣工资的依据。

3. 向调解组织申请调解

   • 如果与公司协商无果，你可以向当地的劳动调解组织申请调解。调解组织会介入双方争议，协助沟通，寻求妥善解决方案。

4. 向劳动监察部门投诉

   • 适用情形：如果你已经毕业并建立了劳动关系，或者虽然未毕业但老板克扣工资的行为严重损害了你的权益，你可以向劳动监察部门投诉。
   • 投诉方式：准备好相关证据材料，前往当地劳动监察大队办公地点进行书面投诉，或者拨打劳动保障监察投诉举报电话12333。根据相关法律法规，劳动监察部门会调查核实情况，若情况属实，会责令老板限期支付工资，并根据情节轻重对老板进行处罚。

5. 申请劳动仲裁

   • 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从你知道或者应当知道自己的权利被侵害之日起计算。
   • 仲裁流程：准备仲裁申请书、身份证明、证据材料等，向当地劳动争议仲裁委员会提交申请。仲裁委员会受理后会安排开庭审理，双方进行举证、质证和辩论。最终，仲裁委员会会根据审理结果作出裁决。若对仲裁结果不满意，可在规定期限内向人民法院提起诉讼。

6. 向法院起诉

   • 诉讼条件：若通过劳动仲裁仍未解决问题，或者你有充分证据且争议金额较小，符合条件的可以直接向法院提起民事诉讼。
   • 诉讼过程：法院会依据双方提供的证据进行审理并作出判决。判决生效后，若老板仍不履行支付工资的义务，你可以向法院申请强制执行。

法律依据：

• 《中华人民共和国劳动法》第九十一条：用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
• 《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条：用人单位未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
• 《劳动保障监察条例》第二十六条：用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的，由劳动保障行政部门责令限期支付劳动者的工资报酬；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。

综上所述，面对老板克扣工资的情况，学生应依法行事，确保自己的合法权益得到维护。从与公司协商到向劳动监察部门投诉，再到申请劳动仲裁和提起诉讼，每一步都应谨慎操作，并确保有足够的证据支持自己的主张。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。