结论前置：一个人同时担任A公司的法定代表人及B公司的股东时，A公司的经济纠纷不一定会直接影响B公司，但需根据具体情况分析，特别是要考虑是否存在公司人格混同、股东或法定代表人的不当行为、个人责任以及两家公司之间的财务或业务关联。以下是对此问题的详细分析：

1. 公司法人独立性与股东有限责任

   • 根据《公司法》的相关规定，公司是企业法人，拥有独立的法人财产，并以其全部财产对公司的债务承担责任。股东则以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。因此，若该法定代表人已按公司章程足额缴纳出资，A公司的经济纠纷通常应由A公司独立承担，不会直接牵连到B公司。

2. 特殊情况下的连带责任

   • 人格混同：如果A公司与B公司在人员、业务、财务等方面存在交叉或混同，导致各自财产无法区分，可能构成“揭开公司面纱”的情形。在这种情况下，法院可能会判决B公司对A公司的债务承担连带责任。
   • 法定代表人的不当行为：若法定代表人在处理A公司事务时，利用其在B公司的股东身份非法转移资产以逃避债务，债权人可以要求B公司返还相关资产或在接受资产范围内承担责任。

3. 个人独资企业与合伙企业的特殊规定（若涉及此类企业）

   • 个人独资企业：如果法定代表人所在的是个人独资企业且出现经济纠纷，其个人财产（包括在B公司的股权）可能被用于偿债，因为个人独资企业的投资人对企业债务承担无限责任。
   • 合伙企业：若法定代表人为普通合伙人，其个人财产可能用于偿债，影响其在B公司的权益；若为有限合伙人，则通常仅以出资为限承担责任。

4. 股东的个人责任

   • 股东一般以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。但若存在出资不实、抽逃出资等情形，股东可能需在未出资本息范围内对公司债务承担补充赔偿责任。若股东为逃避责任不当处置其在B公司的资产，可能引发法律问题，间接影响B公司。

5. 个人责任与信誉影响

   • 若法定代表人在A公司的经济纠纷中被认定有责任，可能需要承担个人赔偿责任。这虽然不会直接转移到其在B公司的股份或权益上，但可能影响其个人信誉和商业活动，进而间接影响在B公司的地位和权益。

6. B公司的风险与管理措施

   • A公司的经济纠纷一般不会直接导致B公司承担责任，除非两家公司存在财务或业务关联。若法定代表人利用B公司地位或资源为A公司提供不当支持或掩盖行为，B公司可能面临法律风险。
   • 建议：作为同时担任两家公司不同职务的人员，应及时了解法律责任和风险，并采取适当措施保护合法权益。例如，确保两家公司的财务和业务独立，避免人格混同；在处理公司事务时遵守法律法规，避免不当行为。同时，B公司应加强内部风险管理，确保与A公司的业务往来符合法律法规，并密切关注事态发展。

综上所述，一人同时担任两家公司的不同职务可能带来复杂性和风险，但通过明确的法律分析和适当的应对措施，可以有效管理这些风险并保护相关方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。