结论：是否需要开票取决于款项性质，以股份名义转账若涉及股权转让或投资款，通常无需开具增值税发票，但需履行股权变更登记等法律程序；若款项被认定为其他应税收入（如借款利息、服务费等），则需依法开票。是否合法需结合款项性质、合同约定及税务合规性综合判断。以下是具体分析：

一、款项性质决定是否需要开票

1. 股权转让款
   若对方以“股份转让”名义支付款项，实际为股权转让对价，根据《增值税暂行条例》及财税〔2016〕36号文，股权转让不属于增值税应税范围，无需开具增值税发票。但需注意：

   • 签订书面《股权转让协议》，明确转让标的、价格、支付方式等；
     
   • 办理工商变更登记，将股权变更信息记载于公司章程及工商档案；
     
   • 若涉及自然人股东，需按“财产转让所得”缴纳20%个人所得税，并由受让方代扣代缴。

2. 投资款（增资扩股）
   若款项为新增注册资本或资本公积，属于公司资本性投入，无需开票。但需履行：

   • 股东会决议同意增资；
     
   • 修改公司章程并办理工商变更；
     
   • 财务上计入“实收资本”或“资本公积”科目。

3. 其他应税收入（需开票情形）
   若款项虽以“股份”名义支付，但实际性质为：

   • 借款利息：需按“金融服务”开具6%增值税发票；
     
   • 咨询服务费：需按“现代服务”开具6%增值税发票；
     
   • 租金收入：需按“不动产租赁”或“有形动产租赁”开具9%或13%发票。
     风险点：若未依法开票，可能被税务机关认定为“隐匿收入”，面临补税、滞纳金及罚款。

二、合法性判断需结合三要素

1. 合同约定与实际履行一致性
   若协议明确约定款项为股权转让款，但实际未办理变更登记，或款项被挪作他用，可能被认定为“名股实债”（实际为借贷），此时需按借贷关系处理，涉及利息的需开票并纳税。

2. 税务合规性

   • 股权转让需申报个人所得税（自然人股东）或企业所得税（法人股东）；
     
   • 增资扩股无需即时纳税，但后续股权转让时需按“投资成本”计算应纳税所得额；
     
   • 若款项被认定为其他收入，需按税法规定申报并开票。

3. 工商登记与财务处理
   未办理工商变更的股权转让，可能被认定为“股权转让合同未生效”，引发纠纷；财务上需准确区分资本性支出与收益性支出，避免混淆。

三、实务建议

1. 明确款项性质：在协议中清晰约定款项用途（如“股权转让款”“增资款”），避免模糊表述；
   
2. 履行法定程序：及时办理工商变更、税务申报等手续，留存完整证据链；
   
3. 咨询专业机构：涉及大额交易或复杂结构时，建议委托律师、会计师审核协议及税务处理方案。
   

提示：若您对具体交易结构或税务处理有疑问，可直接向我提供更多细节（如协议条款、款项用途等），我将进一步为您分析风险点及合规方案。