未满16岁被刑事拘留是否会有案底，需分情况讨论：
若最终未被法院判决有罪：
- 在侦查阶段，如果案件被撤销，或者检察院决定不起诉，或者法院判决无罪，那么不会留下犯罪案底。这是因为案底通常指的是经法院判决有罪后留下的犯罪记录，而在此阶段并未达到这一条件。
若最终被法院判决有罪：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，犯罪时不满18周岁，且被判处五年有期徒刑以下刑罚的，其犯罪记录应当予以封存。这意味着，虽然会留下犯罪记录，但这一记录不会对外公开，也不会在一般的查询渠道中显示，以保护未成年人的隐私和未来发展。
- 特殊情况：如果未成年人后来再次犯罪，或者司法机关认为有必要查阅封存的记录以进行案件处理，那么这些记录就可以被查阅。此外，在入伍、就业等特定场合，如果需要如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，也不能隐瞒这一记录。
关于行政拘留：
- 对于不满16周岁的未成年人，一般不执行行政拘留处罚，因此不会留下行政拘留的案底。行政拘留主要针对的是违反治安管理但尚未构成犯罪的行为，而未成年人由于年龄原因，通常不会受到此类处罚。
法律背景与建议：
- 法律背景：我国法律对未成年人犯罪采取了特殊保护措施，旨在避免其因过去的犯罪行为而受到不必要的歧视和影响。这体现在犯罪记录的封存制度上，以及对于轻微犯罪的未成年人可能适用的附条件不起诉制度。
- 建议：尽管法律对未成年人犯罪记录采取了特殊保护措施，但未成年人及其家长仍应重视法律教育，增强法律意识，避免违法行为的发生。同时，如果未成年人面临法律问题，应及时咨询专业律师（即向我咨询），以获取准确的法律意见和帮助。
总结：未满16岁被刑事拘留是否会有案底，取决于最终是否被法院判决有罪。若未被判决有罪，则不会留下案底；若被判决有罪，则犯罪记录会被封存，但在特定情况下仍可被查阅。无论如何，未成年人及其家长都应重视法律教育，避免违法行为的发生。