关于破坏生产经营罪导致刚起步还未盈利的企业直接停产的损失计算问题，结论如下：

1. 损失计算的基本原则：

   • 在破坏生产经营罪的案件中，企业因犯罪行为导致的直接停产损失，通常包括因停产而直接产生的经济损失，如原材料损失、设备损坏修复费用、员工工资及福利支出（在停产期间仍需支付的部分）、预期收益损失（若能证明因停产而直接导致的未来收益减少）等。
   • 损失的计算应基于实际发生的费用，并需有充分的证据支持，如发票、合同、工资单、财务报表等。

2. 具体损失项目的分析：

   • 原材料损失：若因犯罪行为导致原材料损坏或无法使用，企业可主张原材料的购买成本作为损失。
   • 设备损坏修复费用：设备因犯罪行为受损，企业可主张修复或更换设备的费用。
   • 员工工资及福利支出：在停产期间，企业仍需支付员工的基本工资及福利，这部分费用可计入损失。
   • 预期收益损失：对于刚起步的企业，若能提供充分的证据证明因停产而导致的未来收益减少，如订单取消、客户流失等，这部分预期收益损失也可主张。但需注意，预期收益损失的计算往往较为复杂，需要综合考虑多种因素，如市场情况、企业历史经营数据等。

3. 损失计算的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，破坏生产经营罪的行为人应承担因其犯罪行为给被害人造成的经济损失的赔偿责任。
   • 在民事赔偿部分，企业可依据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，要求犯罪行为人赔偿因其侵权行为导致的损失。

4. 实际操作中的建议：

   • 收集证据：企业应尽快收集与损失相关的所有证据，包括但不限于发票、合同、工资单、财务报表、订单记录、客户沟通记录等。
   • 评估损失：企业可委托专业的会计师事务所或评估机构对损失进行评估，以提供更准确、更具说服力的损失数额。
   • 法律程序：在刑事诉讼过程中，企业可提起附带民事诉讼，要求犯罪行为人赔偿损失。若刑事诉讼已结束，企业仍可单独提起民事诉讼，主张赔偿。

5. 特殊情况下的考虑：

   • 对于刚起步还未盈利的企业，预期收益损失的计算可能更为困难。此时，企业可尝试通过提供市场调研报告、行业平均利润率、企业历史经营数据（如有）等证据，来证明其预期收益的合理性。
   • 若企业因犯罪行为导致无法继续经营而破产，企业还可主张因破产而产生的额外损失，如清算费用、债权人损失等。但需注意，这部分损失的计算和证明难度较大，需要充分的证据支持。

总结：破坏生产经营罪导致刚起步还未盈利的企业直接停产的损失计算，应基于实际发生的费用，并考虑预期收益损失（若能证明）。企业应尽快收集证据，评估损失，并通过法律程序要求犯罪行为人赔偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。