事业单位旷工工资扣发的规定通常依据国家法律法规及单位内部规章制度执行，核心结论如下：

1. 国家层面规定
   根据《事业单位人事管理条例》第十五条，事业单位工作人员旷工或因公外出、请假期满无正当理由逾期不归，连续超过15个工作日或1年内累计超过30个工作日的，单位可解除聘用合同。工资扣发方面，虽无全国统一细则，但《工资支付暂行规定》第十六条明确，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，单位可按劳动合同约定要求赔偿，并从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。旷工本身虽不直接等同于“造成经济损失”，但单位可通过内部制度将旷工与工资扣发挂钩。

2. 单位内部制度依据
   事业单位通常制定《考勤管理办法》或《绩效工资考核办法》，明确旷工的扣发规则。例如：

   • 按日扣发：旷工1天扣发当日基本工资（岗位工资+薪级工资）及绩效工资；
     
   • 累计扣发：旷工3天以上，除扣发当日工资外，可能取消当月绩效工资或年终奖金；
     
   • 特殊岗位：如教师、医生等，旷工可能影响课时费、手术补贴等专项津贴的发放。
     关键点：单位制度需经职工代表大会或全体职工讨论通过，并公示或告知劳动者，否则可能因程序违法被认定无效。

3. 扣发工资的合法边界

   • 不得超比例扣发：即使单位制度规定旷工扣发全部工资，若扣除后工资低于当地最低标准，仍属违法；
     
   • 不得重复处罚：若单位已因旷工解除合同，则无权再扣发工资，否则可能构成“未及时足额支付劳动报酬”；
     
   • 证据要求：单位需提供考勤记录、旷工通知等证据，否则劳动者可主张补发工资。

建议：若您所在单位未公示考勤制度，或扣发比例超出法定范围，可要求单位提供制度依据并协商调整；若已因此发生纠纷，可携带劳动合同、工资条、考勤记录等材料，进一步向我咨询具体维权方案。