在法院申请强制执行立案后，公司打款至法院账户或直接打款给申请执行人，处理方式如下：

1. 若款项打至法院账户

   • 法院通知与核对：法院收到款项后，会通知申请执行人（即你方）核对金额。此时需确认到账金额是否与执行标的（包括本金、利息、迟延履行金、执行费等）一致。
     
   • 执行费扣除：根据《诉讼费用交纳办法》，执行费通常由被执行人（公司）承担，法院会从到账款项中优先扣除执行费，剩余部分发放给你方。
     
   • 领取款项：你方需向法院提交收款账户信息，法院会在核对无误后将款项划转至你方账户。若涉及多个申请执行人，法院可能按比例分配或按执行顺序处理。
     
   • 结案手续：款项发放后，法院会出具《执行结案通知书》，标志着案件执行完毕。你方需妥善保管该文书，以备后续核查。

2. 若公司直接打款给你方

   • 立即通知法院：根据《民事诉讼法》及相关司法解释，被执行人直接履行义务的，申请执行人应立即通知法院，避免法院继续采取执行措施（如查封、冻结等）。
     
   • 提交履行证明：你方需向法院提交公司打款的凭证（如银行转账记录、收据等），证明被执行人已履行义务。法院核实后，会终止执行程序并结案。
     
   • 执行费处理：若公司未主动缴纳执行费，你方可要求法院从已到账款项中扣除，或由公司另行支付至法院账户。

3. 特殊情形处理

   • 款项不足：若到账金额不足以覆盖全部执行标的，法院会继续执行公司剩余财产（如其他银行账户、房产、车辆等），直至标的全部实现或无财产可供执行。
     
   • 公司提出异议：若公司主张打款系其他款项（如非执行款），需向法院提交证据（如合同、付款说明等）。法院会组织听证，根据证据认定款项性质，再决定是否计入执行标的。
     
   • 你方不认可金额：若你认为到账金额与执行标的不符（如利息计算错误），可向法院提出书面异议，法院会审查并作出裁定。若对裁定不服，可在10日内向上一级法院申请复议。

温馨提示：执行过程中，建议保持与法院执行法官的沟通，及时提交材料并跟进进度。若公司打款后未主动告知法院，或你方未及时通知法院，可能导致执行程序重复启动，增加不必要的麻烦。如有其他疑问，可直接向我咨询。