股东出资证明由公司出具。这是有限责任公司成立后，公司必须履行的一项法定义务，旨在确认股东的出资情况并保障其合法权益。以下是对此问题的详细解释：

一、法律依据与重要性

根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，有限责任公司成立后，应当向股东签发出资证明书。这一规定明确了出资证明书作为股东权益保障和出资义务履行的法律凭证的重要性。出资证明书不仅是股东对公司享有权利、承担责任的重要依据，也是公司内部管理和外部交易中的关键法律文件。

二、出资证明书的内容与格式

出资证明书应当载明以下事项，以确保其完整性和准确性：

1. 公司名称：明确记载公司的全称，以便识别。
2. 公司成立日期：记录公司正式成立的日期。
3. 公司注册资本：体现公司的总资本规模。
4. 股东的姓名或者名称、认缴和实缴的出资额、出资方式和出资日期：详细记录股东的个人信息及其出资的具体情况，包括认缴和实缴的出资额、出资方式以及出资时间。
5. 出资证明书的编号和核发日期：确保每份出资证明书都有唯一的标识和核发时间。

出资证明书由公司法定代表人签名，并由公司盖章，以确保其法律效力。

三、出资证明书的作用与意义

1. 确认股东地位：出资证明书是股东在公司中地位的官方证明，是股东行使权利、参与公司经营和管理的基础。
2. 保障股东权益：通过明确记载股东的出资情况和相关信息，出资证明书为股东提供了法律上的权益保障，防止因信息不对称或管理混乱而导致的权益受损。
3. 促进公司治理：出资证明书的签发有助于公司明确股权结构，规范股权管理，减少未来可能出现的股权争议，从而促进公司的健康治理。

四、特殊情况处理

如果公司未按照法律规定向股东签发出资证明书，股东可以依法向公司提出请求，要求其签发出资证明书以确认自己的股东地位和权益。这是股东维护自身合法权益的重要途径。

五、与股份有限公司的区别

值得注意的是，在股份有限公司中，表现股东权益的凭证是股票而非出资证明书。股份有限公司成立后，公司会向股东交付股票作为权益证明。这与有限责任公司的出资证明书在性质和功能上有所不同。

总结与建议：

股东出资证明是有限责任公司中证明股东地位及权益的重要法律文件，由公司依法出具并加盖印章以确保其真实性和有效性。作为股东，应妥善保管自己的出资证明书，以便在必要时维护自身的合法权益。同时，如果公司未依法签发出资证明书，股东也有权依法请求公司签发。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。