使用虚假材料取得营业执照时，违法所得的认定需结合具体情形，通常以行为人通过虚假手段获取营业执照后所获得的实际经济利益为计算依据。具体分析如下：

1. 违法所得的认定原则
   根据《行政处罚法》第二十八条及市场监管领域相关规范，违法所得是指行为人通过违法行为直接或间接获得的全部收入，扣除必要成本后的净收益。在虚假材料取得营业执照的场景中，核心在于判断行为人是否利用该营业执照开展了经营活动并获利。

2. 具体认定情形

   • 未开展经营活动的情形
     若行为人仅取得营业执照但未实际开展经营（如未签订合同、未产生交易流水），则通常不认定存在违法所得。此时行政处罚可能以罚款为主，罚款金额依据《市场主体登记管理条例》第四十四条，可能处5万元至50万元罚款。
   • 已开展经营活动的情形
     若行为人利用虚假营业执照开展经营，违法所得的计算需分两步：
     
     1. 收入总额认定：包括通过该营业执照签订的全部合同金额、实际收到的款项、银行流水记录等直接收入；
        
     2. 必要成本扣除：允许扣除与违法经营直接相关的必要支出（如原材料采购、设备租赁等），但不得扣除税费、罚款等非经营性支出。
        示例：若行为人通过虚假营业执照签订100万元合同，实际收到80万元，扣除成本30万元后，违法所得为50万元。

3. 特殊情形处理

   • 主观恶意与情节严重性：若行为人存在多次虚假登记、造成重大社会影响等情节，可能面临更高罚款（如《公司法》第一百九十八条规定的“情节严重”情形，可处50万元以下罚款），甚至刑事责任（如涉嫌伪造国家机关公文罪）。
     
   • 第三方权益保护：若虚假营业执照导致消费者或合作伙伴损失，行为人除需返还违法所得外，还可能承担民事赔偿责任。

4. 实务建议

   • 自查整改：若已通过虚假材料取得营业执照，应立即停止经营并主动向登记机关说明情况，争取从轻处理；
     
   • 证据固定：保留与经营相关的合同、发票、银行流水等证据，以便在行政调查中准确说明违法所得范围；
     
   • 法律程序：对违法所得认定有异议的，可在行政处罚听证程序中提出陈述申辩，或通过行政复议、诉讼途径维权。

如需进一步分析具体案件中的违法所得计算方式或应对策略，可直接向我说明案件细节，我将结合证据材料提供针对性建议。