结论：工资发两次是否影响挂靠，需根据挂靠的具体类型和目的来综合判断。以下从不同挂靠情形进行分析：

1. 社保挂靠情形：

   • 法律背景：社保挂靠通常指的是个人为了享受社保待遇，而将社保关系挂靠在不实际工作的单位名下。这种行为本身可能涉及虚构劳动关系，违反了社保缴纳的相关规定。
   • 工资发放影响：如果工资被发两次，且其中一次与挂靠单位相关，这可能进一步加剧虚构劳动关系的嫌疑。社保部门在核查时，若发现工资发放记录与实际劳动关系不符，可能会对挂靠行为进行调查，甚至处罚。
   • 法律建议：避免进行社保挂靠，尤其是当工资发放存在异常时。应依法缴纳社保，确保社保关系的真实性和合法性。

2. 资质挂靠情形（如建筑行业资质挂靠）：

   • 法律背景：资质挂靠通常指的是个人或企业不具备某项资质，但为了承接项目而挂靠到具备相应资质的单位名下。这种行为可能违反了行业管理规定和法律法规。
   • 工资发放影响：在资质挂靠中，工资发放可能涉及多个主体，包括挂靠单位、被挂靠单位以及实际工作单位。如果工资被发两次，且涉及不同主体，可能引发对挂靠行为的质疑和调查。特别是当工资发放与项目承接、资质使用等存在关联时，更可能被视为违规行为。
   • 法律建议：严格遵守行业管理规定和法律法规，避免进行资质挂靠。如果确实需要合作，应明确各方权利义务，确保工资发放等财务事项的合法性和透明性。

3. 一般性挂靠（非特定目的）：

   • 法律背景：如果挂靠并非为了特定目的（如社保、资质等），而是出于其他原因（如方便办理某些事务），且不违反法律法规和行业规定，那么工资发放两次可能不直接构成法律问题。
   • 工资发放影响：然而，即使挂靠行为本身不违法，工资发放两次也可能引发对财务合规性的质疑。特别是当挂靠单位与被挂靠单位之间存在经济往来时，工资发放记录可能成为税务、审计等部门核查的重点。
   • 法律建议：确保工资发放的合法性和合规性，避免不必要的财务纠纷和法律风险。如果挂靠行为涉及多个主体或复杂经济关系，建议咨询专业律师或财务顾问，以确保各方权益得到保障。

进一步思考：无论何种类型的挂靠，工资发放两次都可能引发对劳动关系、财务合规性等方面的质疑。因此，在进行挂靠行为时，应谨慎考虑工资发放等财务事项的处理方式，确保符合法律法规和行业规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。