针对您提出的“医疗机构非法开展药流怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规及实际案例为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，医疗机构若未取得母婴保健技术许可而擅自开展药流（即终止妊娠手术），是违反《中华人民共和国母婴保健法》及其相关实施办法的行为。这类行为不仅关乎妇女的生育健康，也涉及到医疗市场的正常秩序和医疗质量安全。

一、法律依据

1. 《中华人民共和国母婴保健法》：

   • 第三十三条第二款规定，从事终止妊娠手术的人员必须经过县级以上地方人民政府卫生行政部门的考核，并取得相应的合格证书。
   • 第三十五条规定，未取得国家颁发的有关合格证书而施行终止妊娠手术的，县级以上地方人民政府卫生行政部门应当予以制止，并可以根据情节给予警告或者处以罚款。

2. 《中华人民共和国母婴保健法实施办法》：

   • 第三十五条第三款规定，从事终止妊娠手术的医疗、保健机构和人员，须经县级人民政府卫生行政部门许可，并取得相应的合格证书。
   • 第四十条规定，医疗、保健机构或者人员未取得母婴保健技术许可，擅自从事终止妊娠手术的，由卫生行政部门给予警告，责令停止违法行为，没收违法所得；违法所得5000元以上的，并处违法所得3倍以上5倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足5000元的，并处5000元以上2万元以下的罚款。

二、处罚措施

根据上述法律法规，医疗机构非法开展药流将面临以下处罚措施：

1. 警告：卫生行政部门会对违规医疗机构或人员发出警告，要求其立即停止违法行为。

2. 责令停止违法行为：违规医疗机构或人员必须立即停止非法开展药流的行为。

3. 没收违法所得：如果违规医疗机构或人员在非法开展药流过程中获得了违法所得，这些所得将被没收。

4. 罚款：

   • 如果违法所得5000元以上，将处以违法所得3倍以上5倍以下的罚款。
   • 如果没有违法所得或者违法所得不足5000元，将处以5000元以上2万元以下的罚款。

三、实际案例

以贵港市覃塘区卫生健康局对甘善芬的行政处罚为例，甘善芬未取得终止妊娠手术的母婴保健技术许可的合格证书，擅自对多名患者施行终止妊娠手术，且没有违法所得。根据相关法律法规，贵港市覃塘区卫生健康局对其作出了警告及罚款9500元的行政处罚。

四、建议

为了避免类似违法行为的发生，我建议医疗机构：

1. 严格遵守法律法规：确保所有医疗行为都符合《中华人民共和国母婴保健法》及其相关实施办法的规定。

2. 申请并取得相关许可：在开展终止妊娠手术等母婴保健技术服务前，必须向县级以上地方人民政府卫生行政部门申请并取得相应的许可和合格证书。

3. 加强内部管理：建立健全内部管理制度，确保医疗行为的合法性和规范性。

综上所述，医疗机构非法开展药流将面临严厉的处罚措施，包括警告、责令停止违法行为、没收违法所得以及罚款等。因此，医疗机构必须严格遵守相关法律法规，确保医疗行为的合法性和规范性。