在法医鉴定为轻伤二级的案件中，双方当事人仍然可以进行调解，但调解主要限于民事赔偿部分，刑事部分需依法进行公诉和审判。以下是对此问题的详细分析：
一、调解的可行性与条件
案件类型与刑罚限制：
- 调解通常适用于因民间纠纷引起的，涉嫌刑法分则第四章（侵犯公民人身权利、民主权利罪）和第五章（侵犯财产罪）规定的犯罪案件，且可能判处三年有期徒刑以下刑罚的情况。轻伤二级案件多属于此类，因此具备调解的基础。
- 对于除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件，同样可以考虑调解。虽然轻伤二级案件多为故意犯罪，但此规定说明了调解在刑事案件中的适用范围。
悔罪表现与被害人意愿：
- 犯罪嫌疑人或被告人必须表现出真诚悔罪的态度，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人的谅解。这是调解成功的重要前提。
- 被害人必须自愿参与调解，双方才能达成和解。如果被害人不同意调解，则无法进行调解程序。
二、调解的程序与效力
调解的申请与受理：
- 双方当事人或其中一方可以向法院提出调解申请。法院会审查案件是否符合调解条件，并决定是否受理调解申请。
调解的准备与实施：
- 法院指定调解员负责调解工作，通知双方当事人参加调解会议，并告知相关注意事项。
- 双方当事人可以委托律师或其他代理人参加调解，以更好地维护自己的权益。
- 在调解会议上，调解员会听取双方陈述，了解事实，引导协商，并提出调解方案。
调解协议的达成与执行：
- 如果双方达成一致意见，调解员会协助起草调解协议书，明确双方的权利和义务。
- 调解协议书经双方当事人签字确认后具有法律效力。双方当事人应按照协议内容履行义务，如一方不履行，另一方可向法院申请强制执行。
三、调解的法律效果与实际意义
对加害方的影响：
- 如果加害方与被害人达成调解并取得其谅解，这在后续的量刑中通常会作为从轻处罚的情节予以考虑，甚至有可能适用缓刑等较轻的刑罚。
对被害人的益处：
- 调解能够较为迅速地帮助被害人获得经济赔偿，弥补因伤害行为所遭受的损失。同时，调解也有助于缓解双方的对立情绪，促进社会和谐。
调解与刑事程序的关系：
- 调解并不等同于撤诉或免除刑事责任。对于加害者所涉及的刑事部分，仍需依法进行公诉和审判。调解结果仅供法官在量刑时参考，不影响刑事案件的审理和判决。
四、实际操作中的注意事项
- 调解协议的合法性：调解协议必须符合法律规定，不得违反法律强制性规定或公序良俗。否则，调解协议可能被认定为无效。
- 调解过程中的证据保留：在调解过程中，双方当事人应保留好相关证据，如医疗记录、赔偿凭证等，以备不时之需。
- 调解不成后的处理：如果调解不成，双方当事人仍可以通过诉讼途径解决纠纷。此时，应准备好相关证据和材料，以便在法庭上维护自己的权益。
总结来说，法医鉴定为轻伤二级的案件中，虽然可以进行调解，但调解主要限于民事赔偿部分。刑事部分仍需依法处理。如果你在此类案件中遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。