结论前置：政府采购中的投标保证金与履约金（通常指履约保证金）在定义、目的、提交时间、金额规定、退还条件及方式以及法律后果等方面均存在显著差异。以下是对这两者的详细对比分析：
一、定义与目的
投标保证金
- 定义：投标人按照招标文件要求向招标人出具的，以一定金额表示的投标责任担保。
- 目的：确保投标人在投标有效期内不撤回投标文件，且中标后能按招标文件要求签署合同。它体现了投标人的严肃性和诚信性，防止其随意撤回投标文件或中标后不签订合同，从而保障招标活动的顺利进行。
履约保证金
- 定义：中标人按照招标文件规定提交的，用于保证履行合同义务的担保。
- 目的：保障中标人能全面、正确地履行合同义务，如按时完成项目、保证工程质量等。它确保了招标人的合同权益，在中标人违约时，招标人有权扣除部分或全部保证金以弥补损失。
二、提交时间
- 投标保证金：需在投标截止时间前，随投标文件一同提交给招标人或其指定机构。
- 履约保证金：在中标通知书收到并签订合同后，按合同约定的时间和方式提交。
三、金额规定
投标保证金
- 比例：通常为投标总价的一定比例，根据《中华人民共和国招标投标法实施条例》（2019年修订）及《工程建设项目施工招标投标办法》（2013年修订），投标保证金不得超过招标项目估算价的2%，且最高限额一般为80万元人民币。
- 确定因素：考虑项目规模、复杂程度及潜在风险。
履约保证金
- 比例：一般为合同金额的一定比例，常见为5%-10%，但不得超过中标合同金额的10%。
- 确定因素：依据合同性质、标的金额、履行期限及风险程度。
四、退还条件与方式
投标保证金
- 退还条件：投标有效期届满，且无违规行为（如撤回投标文件、拒绝签订合同等）时退还。
- 退还方式：原路径、原方式无息退还。招标人最迟应在书面合同签订后5日内退还投标保证金及利息。
履约保证金
- 退还条件：合同全面履行完毕，经验收合格或达约定条件后退还。若中标人违约，招标人有权根据合同约定扣除部分或全部保证金作为违约金或赔偿金。
- 退还方式：原路径、原方式退还，是否计息依合同约定。当中标人全面履行合同义务并经招标人验收合格后，招标人应按约定时间退还履约保证金。
五、法律后果
投标保证金
- 若投标人撤回投标、拒绝签订合同或提供履约保证金等违规行为，招标人有权没收保证金作为惩罚，并要求赔偿超出部分的损失。
履约保证金
- 若中标人未履行合同或履行不符合约定，招标人有权没收保证金以弥补损失。若保证金不足以弥补损失，招标人还可要求中标人承担进一步赔偿责任。
总结与建议：
投标保证金与履约保证金在政府采购活动中各自扮演着重要角色。投标保证金主要保障招标活动的严肃性和有效性，而履约保证金则确保合同能够全面、准确地履行。在实际操作中，招标人和投标人（中标人）应严格遵守相关法律法规和招标文件的规定，确保这两种保证金制度的有效实施。
如果您在政府采购活动中遇到任何与投标保证金或履约保证金相关的问题，或者需要进一步的法律咨询和帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。