入职时签订的三方协议与劳动合同存在显著区别，主要体现在以下几个方面：
主体不同
- 三方协议：涉及三方主体，即毕业生、学校和用人单位。学校在其中主要扮演鉴证、管理和指导的角色，旨在维护毕业生就业秩序，保障毕业生和用人单位的合法权益。
- 劳动合同：仅涉及两方主体，即劳动者（毕业生）和用人单位。它是确立劳动关系、明确双方权利义务的正式协议。
签订时间不同
- 三方协议：通常在毕业前的最后一年签订，作为毕业生就业意向的初步确认。此时，毕业生尚未正式毕业，处于求职阶段。
- 劳动合同：在毕业生毕业后，正式到用人单位报到上班时签订。根据《劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应在一个月内订立书面劳动合同。
内容差异
- 三方协议：主要侧重于毕业生就业过程的约定，如不得随意毁约、用人单位不得拒收等。它通常不涉及具体的劳动权利和义务，如工作时间、地点、薪酬等。
- 劳动合同：内容详尽且具体，包括用人单位信息、劳动者个人信息、劳动合同期限、工作内容、工作地点、工作时间、休息休假、劳动报酬、社会保险、劳动保护等多个方面。这些条款均受《劳动法》和《劳动合同法》的严格规范。
法律依据与调整方式
- 三方协议：属于民事协议范畴，主要受《民法典》等民事法律法规的调整。违反三方协议约定的，可依据《民法典》追究违约责任。
- 劳动合同：受《劳动法》和《劳动合同法》等劳动法律法规的专门调整。这些法律对劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止等方面均有明确规定，旨在全面保护劳动者的合法权益。
法律效力与持续性
- 三方协议：其效力具有阶段性，仅在毕业生到用人单位报到并被正式接收前有效。一旦毕业生正式入职，三方协议的效力即告终止。
- 劳动合同：是确立劳动关系的法律依据，具有持续的约束力。在劳动者与用人单位的劳动关系存续期间一直有效，双方均需严格遵守合同约定。
法律建议：
- 毕业生在求职过程中应仔细区分三方协议与劳动合同，根据实际情况合理签订。
- 在签订任何协议或合同时，都应认真阅读条款内容，特别是关于劳动权利和义务的部分，确保自身权益得到充分保障。
- 如遇法律问题或纠纷，如用人单位违反三方协议或劳动合同约定，应及时向我咨询，以便获取专业的法律援助。
总结：三方协议与劳动合同在主体、签订时间、内容、法律依据与调整方式以及法律效力与持续性等方面均存在显著差异。毕业生在求职过程中应充分了解这些差异，并根据自身情况合理选择和签订相关协议或合同。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。