核心结论：男女之间发生关系后怀孕协议书若要有效，需满足法律规定的合同生效要件，同时要特别注意协议内容的合法性、合理性与可操作性。以下从协议生效要件、协议内容要点、注意事项三个方面为你详细阐述。

协议生效要件

1. 行为人具有相应的民事行为能力：签订协议的男女双方都应当是完全民事行为能力人，即年满18周岁且精神状态正常，能够独立进行民事活动并承担民事责任。如果一方是限制民事行为能力人（如16周岁以上不满18周岁以自己的劳动收入为主要生活来源的除外）或者无民事行为能力人，那么其签订的协议可能无效或者效力待定。
2. 意思表示真实：协议必须是双方真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。例如，一方以威胁手段迫使另一方签订协议，那么该协议可能被撤销。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：协议内容不能违反法律的禁止性规定，也不能违背社会公共秩序和善良风俗。比如，协议中约定一方放弃对胎儿的法定抚养义务，这种约定因违反法律的强制性规定而无效。

协议内容要点

1. 双方基本信息：包括男女双方的姓名、身份证号码、联系方式等，明确协议的主体。
2. 怀孕事实确认：清晰说明双方发生关系导致女方怀孕这一事实，可注明怀孕的时间、相关检查结果等作为依据。
3. 双方权利与义务
   • 男方：可以约定男方在女方怀孕期间及孩子出生后的经济支持义务，如承担产检费用、分娩费用、孩子出生后的抚养费等；也可以约定男方在女方怀孕期间的陪伴、照顾等义务。
   • 女方：明确女方有妥善照顾自己和胎儿健康的义务，如按照医嘱进行产检、合理饮食、注意休息等；若女方决定终止妊娠，可约定相关事宜及双方的责任；若女方决定生育，可约定孩子出生后的抚养、教育等方面的配合义务。
4. 违约责任：如果一方违反协议约定，应承担相应的违约责任。例如，男方未按时支付抚养费，应按照一定比例支付逾期违约金；女方未履行照顾胎儿健康的义务，导致胎儿受到损害，应承担相应的赔偿责任。
5. 争议解决方式：约定双方在履行协议过程中发生争议的解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。如果选择仲裁，需明确仲裁机构；如果选择诉讼，可约定管辖法院。
6. 协议变更与解除：说明在何种情况下协议可以变更或解除，以及变更或解除的程序和条件。例如，因不可抗力或双方协商一致等情况可以变更或解除协议。

注意事项

1. 协议内容合法合理：避免约定一些违法或显失公平的内容，如前面提到的放弃法定抚养义务等。同时，协议内容要符合道德伦理标准，不能违背公序良俗。
2. 保留相关证据：在签订协议前后，双方应保留好与怀孕、协议签订等相关的证据，如聊天记录、医疗记录、协议签订时的照片或视频等，以备不时之需。
3. 及时履行协议义务：双方应按照协议约定及时履行各自的义务，避免因拖延或拒绝履行而引发纠纷。如果一方确实无法履行义务，应及时与对方沟通协商，寻求解决方案。

如果你在撰写或理解这份协议书过程中还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。