非营运客车作为通勤车使用，若未按规定办理营运手续，将面临行政处罚，具体处罚措施需根据实际违法情形确定。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律定性角度

非营运客车，顾名思义，是指未取得营运资质，不得从事营业性运输活动的客车。当这类车辆被用于通勤，即定期、固定线路地接送员工上下班等营业性活动时，若未依法办理营运手续，就构成了非法营运。根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的，由县级以上道路运输管理机构责令停止经营；有违法所得的，没收违法所得，处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

二、处罚具体情形角度

1. 首次违法且情节轻微：如果非营运客车首次被用于通勤，且情节轻微，比如接送人数较少、未造成严重后果等，道路运输管理机构可能会根据具体情况，给予警告、责令改正，并处以相对较低的罚款，如3万元以上5万元以下。
2. 多次违法或情节严重：如果车辆多次被用于非法营运通勤，或者接送人数众多、存在超载、超速等严重违法行为，那么处罚将会更加严厉。除了没收违法所得外，罚款金额可能会达到违法所得的10倍，或者在没有违法所得的情况下，处以10万元的罚款。同时，如果行为构成犯罪，如危险驾驶罪等，还将依法追究刑事责任。

三、实际执行角度

在实际执行过程中，道路运输管理机构会综合考虑多种因素，如违法行为的性质、情节、社会危害程度以及当事人的态度等，来决定具体的处罚措施。因此，即使是非营运客车用于通勤的同一违法行为，在不同情况下也可能面临不同的处罚结果。

建议：如果你或你所在的企业有使用非营运客车作为通勤车的需求，务必确保车辆已依法办理营运手续，或者选择具有合法营运资质的运输企业来提供通勤服务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。