结论：违法所得即使被用于缴纳罚款，仍需依法追缴或没收，二者并行不悖，违法所得不会因已缴纳罚款而免除处理。以下是具体分析：

1. 违法所得与罚款的性质不同
   违法所得是行为人通过违法行为直接获得的利益（如销售假货的收入、贪污的款项等），属于“赃款赃物”，其本质是非法财产，需依法追缴或没收，目的是剥夺不法利益、恢复法律秩序。
   罚款则是行政机关或司法机关对违法行为人附加的经济处罚，属于“惩罚性措施”，目的是制裁违法行为、预防再犯。
   二者针对的对象和法律目的不同，因此违法所得不会因被用于缴纳罚款而“抵消”或免除追缴。

2. 法律对违法所得的处理原则
   根据《刑法》第六十四条（刑事领域）和《行政处罚法》第二十八条（行政领域），违法所得必须依法追缴、退赔或没收，上缴国库或返还被害人。例如：

   • 刑事案件中，即使被告人已用违法所得缴纳罚金（刑事罚款），法院仍会单独追缴违法所得；
     
   • 行政案件中，行政机关可同时责令退还违法所得并处以罚款，二者互不影响。
     核心逻辑：违法所得是“非法财产的清理”，罚款是“对违法行为的惩罚”，法律要求“双管齐下”。

3. 实务中的操作方式
   若违法所得已被用于缴纳罚款，实务中通常按以下步骤处理：

   • 追缴违法所得：要求行为人以其他合法财产补足违法所得金额（如用其他资金退赔）；
     
   • 执行罚款：若行为人无其他财产，可能先追缴违法所得，再对剩余部分执行罚款（但罚款不因违法所得已处理而减免）；
     
   • 特殊情形：若违法所得与罚款金额完全重合（如用全部违法所得缴纳罚款），可能需通过司法程序明确追缴与罚款的优先级，但最终仍需确保违法所得被依法处理。

总结：违法所得与罚款是独立的法律责任，缴纳罚款不能替代对违法所得的追缴。若您遇到具体案件（如行政处罚、刑事案件中涉及违法所得处理），可进一步说明情况，我会结合细节为您分析法律适用和应对策略。