一般情况下，不能直接查封法人股东的自然人股东的账户，但在特定情形下可以查封。具体分析如下：
- 公司财产与股东财产的独立性原则
根据《公司法》的规定，公司具有独立的法人财产权，股东以其出资额为限对公司承担责任。这意味着公司的财产与股东的财产是相互独立的，公司的债务原则上不能直接追溯到股东的个人财产，包括自然人股东的账户。因此，在一般情况下，不能直接查封法人股东的自然人股东的账户。
特定情形下的财产混同与法人人格否认
- 如果存在股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的情形，根据《公司法》第二十条的规定，可以否认公司的法人人格，将公司债务视为股东债务，从而查封股东的个人财产，包括自然人股东的账户。这通常需要证明股东与公司之间存在财产混同、业务混同、人员混同等情形。
- 在司法实践中，法院会严格审查是否存在法人人格否认的情形，并要求债权人提供充分的证据来支持其主张。
股东未履行出资义务或抽逃出资
- 如果自然人股东未履行或未全面履行出资义务，或者抽逃出资，根据《公司法》及其司法解释的规定，公司或其他股东可以要求其补足出资，并在特定情况下，公司债权人也可以要求其在未出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。在这种情况下，如果自然人股东拒不履行相关义务，法院可能会查封其个人财产，包括账户。
其他特殊情形
- 在某些特殊情况下，如自然人股东与公司之间存在不当得利、侵权等法律关系，且该法律关系与公司的债务存在直接关联时，法院也可能根据具体情况查封自然人股东的账户。