在机动车与非机动车发生交通事故且双方负有同等责任的情况下，赔偿问题确实需要综合考虑多个因素，包括交强险、商业险以及责任比例等。以下是对此类事故赔偿问题的详细解答：
一、赔偿原则与法律依据
首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险（即交强险）责任限额范围内予以赔偿。这是赔偿的首要原则，不区分责任比例。
对于超出交强险赔偿限额的部分，则按照双方的责任比例进行分担。在机动车与非机动车同责的情况下，虽然具体比例可能因地区而异，但通常机动车方会承担较高比例（如60%），非机动车方承担较低比例（如40%）。
二、交强险范围内的赔付
交强险对非机动车方的人身伤亡和财产损失进行赔偿，且不区分责任比例。其赔偿限额包括：
在事故发生后，首先由机动车的交强险在上述限额内全额承担非机动车方的损失。
三、超出交强险部分的赔付
责任比例分担：超出交强险赔偿限额的部分，按照双方的责任比例进行分担。如前所述，机动车方通常承担60%，非机动车方承担40%。
商业三者险的作用：如果机动车投保了商业三者险，那么超出交强险的部分将由保险公司根据保险合同进行赔偿。例如，若非机动车方产生5万元医疗费用，交强险赔付1.8万元后，剩余3.2万元按责任比例分担，若机动车方承担60%，则商业三者险需赔偿1.92万元。
未投保商业三者险的情况：如果机动车未投保商业三者险，那么超出交强险的部分将由机动车方自行承担相应责任比例的赔偿。
四、非机动车方对机动车方的赔偿
在双方同责的情况下，非机动车方也需对机动车方的损失承担赔偿责任。由于非机动车方往往没有保险，这部分赔偿可能需要通过协商或法律途径解决。具体来说，机动车方的维修费用等损失，非机动车方应承担相应比例（一般为50%，但具体比例也可能因地区而异）。
五、处理建议
及时报警与保护现场：事故发生后，应立即报警并保护现场，以便后续的责任认定和赔偿处理。
收集证据：收集相关证据，如事故现场照片、证人证言、医疗记录等，以支持自己的权益主张。
与保险公司联系：及时通知保险公司并参与理赔流程，确保自身权益得到保障。
理性沟通与协商：双方在事故发生后应保持冷静，尝试通过协商的方式解决赔偿问题。如果协商不成，可以通过申请交警调解或向人民法院提起民事诉讼等法律途径来解决纠纷。
综上所述，机动车与非机动车发生交通事故且双方负有同等责任时，赔偿问题需要综合考虑交强险、商业险以及责任比例等多个因素。在处理此类事故时，应遵循相关法律法规，并及时采取措施保护自己的合法权益。