您好，关于果树赔偿标准的制定部门，这并不是一个全国统一由单一部门来制定的标准。实际上，果树的赔偿标准会受到多种因素的影响，包括果树种类、树龄、生长状况、市场价格、损失程度、因果关系，以及所在地区的法律规定和具体政策等。
一、政府部门的角色
在多数情况下，各地政府会根据本地区的实际情况，制定适用于当地的果木树征收补偿标准。这些标准通常会报上一级人民政府批准后执行，以确保其合法性和合理性。因此，您可以首先咨询当地的自然资源部门或林业部门，了解他们是否制定了相关的赔偿标准。
二、评估机构的参与
对于一些情况特殊或政府未制定明确标准的果木树，可能会需要聘请专业的资产评估机构进行综合评估。这些评估机构会根据果树的实际情况，包括种类、树龄、生长状况、市场价格等因素，来确定其价值，并据此提出赔偿建议。
三、协商赔偿的可能性
在征收过程中，征收方和果木树所有者也可以就赔偿问题进行协商。双方可以在遵循公平、合理、自愿的原则下，达成双方都能接受的赔偿协议。这种方式更加灵活，能够更好地满足双方的实际需求。
四、实际操作建议
咨询当地部门：我建议您首先咨询当地的自然资源部门或林业部门，了解他们是否制定了相关的赔偿标准，以及这些标准的具体内容。
寻求专业帮助：如果您对赔偿标准有疑问或需要更详细的解释，可以考虑聘请专业律师进行法律咨询。律师可以根据相关法律法规和实际情况，为您提供专业的法律意见和指导。
保留相关证据：在协商或诉讼过程中，保留与果树价值相关的证据是非常重要的。这包括果树的种类、树龄、生长状况、市场价格等信息，以及任何能够证明果树价值的照片、视频或评估报告等。
总之，果树赔偿标准的制定是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多种因素。我希望这些信息能够帮助您更好地了解果树赔偿标准的制定部门和相关流程。如果您有任何其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。