按摩店被查后是否能够继续营业，需根据具体情况判断，主要取决于被查原因、是否受到行政处罚或刑事立案以及整改情况。以下分情况详细说明：

1. 若被查原因是存在轻微违规行为（如未悬挂营业执照、卫生不达标等）
   此类情况通常由市场监管、卫生等部门进行行政检查。若未被责令停业整顿或吊销相关证照，且店主及时完成整改（如补办手续、改善卫生条件等），一般可以继续营业。但需注意保留整改证明，避免再次被查时因同一问题受罚。

2. 若被查原因是涉嫌违法经营（如提供色情服务、无证经营医疗按摩等）
   此类行为可能涉及《治安管理处罚法》《刑法》或《医疗机构管理条例》等法律。若被公安机关立案侦查或被卫生部门认定为非法行医，通常会面临停业整顿、罚款甚至刑事责任，此时需暂停营业直至案件处理完毕。若被吊销营业执照或相关许可证，则需重新申请资质后才能恢复营业。

3. 若被查后收到《责令改正通知书》或《行政处罚决定书》
   需严格按要求整改并缴纳罚款。若在规定期限内未整改或拒不执行处罚决定，行政机关可能采取强制措施（如查封场所、扣押设备等），此时继续营业可能构成“拒不执行行政决定”，面临更严厉处罚。

4. 若被查后涉及刑事案件（如组织卖淫罪、非法经营罪等）
   公安机关会立案侦查，店铺可能被查封，相关责任人可能被采取刑事强制措施（如拘留、逮捕）。在刑事诉讼程序终结前，店铺通常无法继续营业，且责任人可能面临有期徒刑、罚金等刑罚。

建议行动步骤：

• 立即停止可能违法的经营行为，配合调查并保留相关证据（如检查文书、整改记录等）；
  
• 咨询专业律师分析被查原因及法律风险，制定应对方案；
  
• 若涉及行政处罚，可依法申请行政复议或提起行政诉讼；
  
• 若涉及刑事案件，尽快委托律师介入，争取从轻或减轻处罚。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。