结论：员工因工作中一件事漏做而被扣工资100元是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合法情形
公司规章制度合法且已告知员工：
- 如果公司有明确的规章制度，规定员工因工作疏忽或失误导致公司损失或未完成工作任务时，可以扣除一定比例的工资作为惩罚，并且该规章制度已经通过合法程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定），且已向员工公示或告知，那么在这种情况下，扣除100元工资可能是合法的。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
扣除金额合理且未低于最低工资标准：
- 即使公司有合法的规章制度可以扣除工资，扣除的金额也必须合理，且扣除后的工资不得低于当地的最低工资标准。如果扣除100元后，员工的工资仍然高于最低工资标准，那么这种扣除可能是合法的。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、不合法情形
公司规章制度不合法或未告知员工：
- 如果公司没有明确的规章制度，或者规章制度没有经过合法程序制定，或者没有向员工公示或告知，那么公司无权扣除员工的工资。在这种情况下，扣除100元工资是不合法的。
扣除金额不合理或低于最低工资标准：
- 如果公司扣除的工资金额不合理，或者扣除后的工资低于当地的最低工资标准，那么这种扣除也是不合法的。例如，如果员工的工资本身就不高，扣除100元后可能低于最低工资标准，那么公司就不能扣除这100元。
扣除工资与工作失误无直接关联：
- 如果员工的工作失误并未给公司造成实际损失，或者扣除的工资与工作失误无直接关联，那么公司也无权扣除员工的工资。例如，员工只是漏做了一件小事，并未对公司造成任何影响，那么公司就不能因此扣除员工的工资。
建议：如果您认为公司扣除工资的行为不合法，您可以先与公司进行协商，要求公司说明扣除工资的理由和依据。如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。