当电动自行车闯红灯撞了汽车时，处理流程需要严谨且有序，以确保事故得到公正、合理的解决。以下是一套详细的处理步骤及建议：

一、立即停车并保护现场

1. 确保安全：电动自行车驾驶员和汽车驾驶员都应立即将车辆停至不妨碍交通的地方，开启危险报警闪光灯（双闪），并在车后设置警示标志，如三角牌，以防止二次事故的发生。

2. 保护现场：在确保安全的前提下，尽量保持事故现场原状，避免移动车辆或相关物品，以免破坏证据。同时，使用手机等设备从多个角度拍照或录像，记录事故发生的位置、车辆碰撞部位、刹车痕迹、信号灯状态等重要信息。

二、报警与责任认定

1. 拨打报警电话：立即拨打122或110报警电话，向交警准确报告事故发生的时间、地点、大致情况等信息，并等待交警到场处理。在等待过程中，保持电话畅通以便进一步沟通。

2. 交警调查与责任认定：交警到达现场后，会进行详细的勘查和询问，收集现场证据，了解事故发生的经过和原因。根据调查结果，交警会依据《道路交通安全法》等相关法律法规，对事故责任进行认定，并出具交通事故责任认定书。一般情况下，电动自行车闯红灯会被认定为存在明显过错，可能承担主要责任。但若汽车存在超速、酒驾等违法行为，责任划分可能会根据双方过错程度进行调整。

三、人员救治与保险理赔

1. 优先救治伤者：若有人员受伤，应立即拨打120急救电话，确保伤者得到及时救治。在救治过程中，垫付的医疗费用应保留好票据，以便后续通过保险或诉讼进行追偿。

2. 保险报案：汽车车主需向交强险和商业险公司报案，说明事故情况。若电动自行车有购买意外险或第三方责任险，也应同步报案，以便保险公司进行理赔。

3. 定损与赔偿：保险公司会根据责任比例赔付车辆维修费用。对于人身伤害赔偿，包括医疗费、误工费、残疾赔偿金等，需根据实际损失和责任划分进行协商或诉讼解决。

四、协商调解与法律途径

1. 交警调解：在责任认定书出具后，双方可在交警的主持下进行协商调解，就赔偿金额和方式达成一致意见。

2. 诉讼解决：若协商不成，可向事故发生地法院提起诉讼。诉讼过程中需提供相关证据支持自己的诉求，如事故责任认定书、医疗记录及费用清单、收入证明（用于误工费计算）、车辆维修发票等。

五、特殊情形处理与预防措施

1. 特殊情形处理：若电动自行车超标被认定为机动车，驾驶人可能面临无证驾驶处罚，且需按机动车标准承担赔偿责任。若电动自行车逃逸，将被追责，情节严重者可能构成交通肇事罪。

2. 预防措施建议：为避免类似事故的发生，电动自行车驾驶员应严格遵守交通规则，避免闯红灯、逆行等行为。同时，骑行时应佩戴头盔等安全装备，降低伤亡风险。此外，定期检查车辆，确保刹车、灯光等功能正常也是非常重要的。

总之，在处理电动自行车闯红灯撞了汽车的事故时，应遵循法律法规的规定，以合法、合理、公平的方式解决问题。同时，也提醒广大驾驶员要严格遵守交通规则，确保行车安全。