挪用公款已还上且超过追诉期的，一般不再追究刑事责任，但民事责任并不免除。若案件已被司法机关立案或受理且犯罪嫌疑人逃避侦查、审判，则不受追诉期限制。以下是对这一结论的详细解释：
一、刑事责任方面
追诉时效的法律规定：
- 根据《中华人民共和国刑法》第八十七条的规定，犯罪经过一定的期限后不再追诉。具体期限根据法定最高刑的不同而有所差异，如法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年不再追诉（若二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准）。
不同诉讼阶段的处理方式：
- 侦查阶段：若挪用公款案件在侦查中发现已超过追诉期，侦查机关应撤销案件。
- 审查起诉阶段：案件移送检察院后，若发现超过追诉期，人民检察院应作出不起诉决定。
- 审判阶段：案件进入审判阶段后，若查明被告人已过追诉时效，法院应裁定终止审理。
特殊情况的例外：
- 若挪用公款案件已被人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或在人民法院受理案件后，犯罪嫌疑人逃避侦查或审判，则不受追诉期限的限制，仍可追究刑事责任。
- 同样，若被害人在追诉期限内提出控告，而人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的，也不受追诉期限的限制。
二、民事责任方面
- 虽然超过追诉期后刑事责任不再追究，但民事责任并不因此免除。若被挪用的公款尚未归还，相关单位或个人仍有权要求挪用者承担还款责任。这可以通过民事诉讼等方式来实现，以维护自身的合法权益。例如，单位可以起诉挪用者要求归还被挪用的公款及相应的利息损失。
三、实际案例与法律建议
- 实际案例：假设某人因挪用公款被立案侦查，但在侦查过程中发现该行为已超过追诉时效期限。在此情况下，侦查机关应撤销案件，不再追究其刑事责任。然而，如果单位因此遭受了经济损失，单位仍可以通过民事诉讼的方式要求该人承担民事责任。
- 法律建议：对于挪用公款的行为人而言，即使已超过追诉期，也应主动归还被挪用的公款以避免民事纠纷。对于单位而言，如果发现员工有挪用公款的行为，应及时报警并保留相关证据以便在追诉期内追究其刑事责任；若已超过追诉期，则应考虑通过民事诉讼的方式维护自身权益。
综上所述，挪用公款已还上且超过追诉期的处理方式需综合考虑刑事责任和民事责任两个方面。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。