结论：公益组织向商会转账是否违法，不能一概而论，需根据转账的具体目的、资金来源及用途、是否符合相关法律法规及组织章程等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合法转账的情形
符合组织章程和目的：
- 如果公益组织和商会之间的转账行为符合双方的组织章程，且转账目的与双方的公益或商业目标相契合，例如共同开展公益项目、进行慈善捐赠等，且资金用途合法合规，那么这种转账行为通常是合法的。
资金来源合法：
- 转账的资金必须来源于合法渠道，如公益组织的捐赠收入、政府补助等。如果资金来源非法，如涉及洗钱、诈骗等违法犯罪活动，那么转账行为自然也是违法的。
遵守相关法律法规：
- 转账行为必须遵守国家相关法律法规，如《中华人民共和国公益事业捐赠法》、《中华人民共和国慈善法》等。这些法律法规对公益组织的资金使用、捐赠行为等都有明确规定，转账行为需符合这些规定。
二、可能违法的情形
资金用途不当：
- 如果公益组织将资金转账给商会后，商会将资金用于非公益目的，如商业投资、个人消费等，且这种用途与公益组织的宗旨和章程相违背，那么这种转账行为可能构成违法。
违反财务规定：
- 公益组织和商会都需遵守严格的财务规定，如资金管理、会计核算等。如果转账行为违反了这些规定，如未进行规范的会计核算、未履行审批程序等，那么也可能构成违法。
涉及利益输送：
- 如果公益组织与商会之间存在利益输送关系，如通过转账行为进行利益交换、谋取私利等，那么这种转账行为不仅违法，还可能构成犯罪。
三、法律建议
明确转账目的和用途：
- 在进行转账前，公益组织和商会应明确转账的具体目的和用途，并确保这些目的和用途符合双方的章程和法律法规。
完善内部审批和监管机制：
- 双方应建立完善的内部审批和监管机制，确保转账行为经过规范的审批程序，并对资金使用情况进行有效监管。
咨询专业法律意见：
- 在进行转账前，建议双方咨询专业法律意见，以确保转账行为的合法性和合规性。
进一步思考：在实际操作中，公益组织和商会之间的转账行为可能涉及复杂的法律关系和财务问题。因此，在进行转账前，双方应充分了解相关法律法规和财务规定，并谨慎评估转账行为的合法性和合规性。如果有任何疑问或不确定之处，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。