当犯罪嫌疑人在取保候审期间被发现有新的犯罪事实时，司法机关将依法进行一系列处理，包括重新评估取保候审措施、对新罪展开侦查、审查起诉以及审判量刑等。以下是对此问题的详细分析：
一、对取保候审措施的处理
报告义务与重新评估：
- 一旦发现犯罪嫌疑人在取保候审期间有新的犯罪事实，律师或相关人员应立即向决定取保候审的机关（如法院、检察院或公安机关）报告。
- 司法机关将重新评估犯罪嫌疑人是否符合取保候审的条件。若认为犯罪嫌疑人存在较大的社会危险性或可能妨碍案件侦查、起诉和审判，一般会变更强制措施，如逮捕羁押。
强制措施变更的具体操作：
- 已交纳保证金的，还可能没收部分或全部保证金，并责令具结悔过、重新交纳保证金、提出保证人，或者监视居住。
- 例如，若张某因涉嫌盗窃罪被取保候审，期间又实施诈骗犯罪，公安机关发现后，会提请检察院批准逮捕张某，检察院审查符合逮捕条件的，将作出逮捕决定并执行。
二、对新罪和旧罪的处理
侦查阶段：
- 司法机关将对新发现的犯罪事实展开全面侦查，收集相关证据，包括询问证人、勘查现场、调取监控等。
- 同时，对之前的犯罪事实也会进一步核实和完善证据，确保案件材料的完整性和准确性。新罪和旧罪的证据将分别整理，为后续审查起诉做准备。
审查起诉阶段：
- 侦查终结后，公安机关会将新罪和旧罪的案件材料一并移送至检察院审查起诉。
- 检察院将对全案进行细致审查，判断犯罪事实是否清楚，证据是否确实、充分。符合起诉条件的，检察院将以新罪和旧罪一并向法院提起公诉。
审判阶段与数罪并罚：
- 法院在审理时，会对新罪和旧罪分别进行审理和量刑。
- 根据《中华人民共和国刑法》第六十九条的数罪并罚原则，判决宣告以前一人犯数罪的，除判处死刑和无期徒刑的以外，应在总和刑期以下、数刑中最高刑期以上，酌情决定执行的刑期。例如，若李某因非法拘禁罪被判有期徒刑2年，又因聚众斗殴罪被判有期徒刑3年，法院可能会在3年以上5年以下决定最终执行刑期。
三、保证金与保证人责任的处理
保证金处理：
- 被取保候审人在取保候审期间若触犯新罪，其已交纳的保证金可能会被部分或全部没收。具体处理方式将视新犯罪的性质和严重程度而定。若行为人故意重新犯罪，保证金将被直接没收。
保证人责任追究：
- 如果犯罪嫌疑人提供了保证人进行取保候审，而保证人在取保候审期间未能有效履行其保证义务，他们也可能面临相应的法律责任追究。
四、律师的作用与责任
- 在整个过程中，律师应积极为犯罪嫌疑人提供法律咨询和帮助，确保其合法权益得到充分保障。
- 律师应密切关注案件的进展情况和司法机关的处理决定，及时通报相关信息并给出相应的法律建议。
- 律师还应积极配合司法机关的调查工作，提供必要的法律支持和协助。
总结与建议：
当犯罪嫌疑人在取保候审期间被发现有新的犯罪事实时，司法机关将依法进行一系列严格的处理措施。这不仅涉及对取保候审措施的重新评估，还包括对新罪和旧罪的全面侦查、审查起诉以及审判量刑。在此过程中，律师的积极参与和配合是维护犯罪嫌疑人合法权益的重要保障。因此，建议犯罪嫌疑人及其家属在遇到此类情况时，及时咨询并委托专业律师提供法律帮助，以确保案件的公正、公平和合法处理。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。