在机动车与行人的交通事故中，若机动车被认定为主责、行人次责，赔偿问题主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关司法解释来处理。核心结论是：赔偿会先由交强险在限额内赔偿，不足部分由商业险或机动车方按责任比例赔偿，行人也会根据其责任比例承担相应损失。以下是具体分析：
交强险的赔偿：
- 无论机动车方是否有责任，交强险都会在限额内进行赔偿。这包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。
- 如果行人受伤，交强险会先赔偿行人的医疗费用、伤残赔偿金等，直至达到限额。
超出交强险部分的赔偿：
- 超出交强险赔偿限额的部分，将根据机动车和行人的责任比例来分担。
- 既然机动车被认定为主责，那么它通常需要承担较大比例的赔偿责任，这个比例可能因地区和具体案情而有所不同，但一般是70%至90%。
- 行人作为次责方，也需要承担一定比例的责任，通常是10%至30%。
商业险的赔偿：
- 如果机动车购买了商业第三者责任险，那么超出交强险部分且应由机动车方承担的赔偿责任，可以由商业险来赔偿。
- 商业险的赔偿限额和条件会根据保险合同的约定来确定。
行人自行承担的部分：
- 行人根据其责任比例，需要自行承担一部分损失。这部分损失可能包括医疗费用、误工费、伤残赔偿金等的一部分。
特殊情况下的赔偿：
- 如果行人故意造成交通事故，机动车方不承担赔偿责任。
- 如果机动车方没有过错，但根据法律规定需要承担一定比例的赔偿责任（如不超过10%），那么这部分赔偿责任也可能由交强险来承担，不足部分再由机动车方自行承担（如果有商业险，则由商业险承担）。
举例说明：假设一起交通事故中，机动车被认定为主责（承担80%责任），行人次责（承担20%责任）。总损失为100万元，其中交强险赔偿限额为20万元。那么，交强险会先赔偿20万元，剩余的80万元中，机动车方需要承担64万元（80%×80万元），行人自行承担16万元（20%×80万元）。如果机动车方购买了商业第三者责任险，且赔偿限额足够，那么这64万元可以由商业险来赔偿。
在处理这类事故时，建议机动车方和行人都及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。