与16周岁女生发生关系是否构成犯罪，需分情况讨论，核心在于是否违背女方意志及是否存在其他法定情形，具体分析如下：

1. 若女方自愿且无其他法定情形，一般不构成犯罪
   根据《中华人民共和国刑法》第十七条及第二百三十六条，与已满14周岁的女性自愿发生性关系，若未使用暴力、胁迫或其他手段强迫，且女方具备自主判断能力，通常不构成强奸罪。但需注意：

   • 年龄界限：16周岁女性已达到我国刑法规定的“妇女”年龄标准（14周岁以上），但若女方实际年龄未满14周岁（即使自称16周岁），仍可能构成强奸罪（从重处罚）。
     
   • 自愿性：若女方因智力障碍、精神疾病等无法表达真实意愿，即使表面“自愿”，也可能构成强奸罪。

2. 若存在以下情形，可能构成犯罪

   • 强迫行为：使用暴力、胁迫、麻醉等手段迫使女方发生关系，直接构成强奸罪（《刑法》第二百三十六条），处三年以上十年以下有期徒刑；情节恶劣或致重伤、死亡等后果的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或死刑。
     
   • 特殊身份关系：若男方为女方监护人、教师、医生等负有特殊职责的人员，利用优势地位或女方信任与其发生关系，即使女方“自愿”，也可能构成负有照护职责人员性侵罪（《刑法》第二百三十六条之一），处三年以下有期徒刑；情节恶劣的，处三年以上十年以下有期徒刑。
     
   • 女方未满14周岁：若误判女方年龄（如女方谎报年龄），但根据客观证据（如户籍证明、学校记录等）可证明其实际未满14周岁，仍以强奸罪论处，且从重处罚。

3. 处理建议

   • 立即停止行为：若关系已发生且存在上述风险情形，应立即停止接触并避免进一步接触女方。
     
   • 保留证据：如聊天记录、监控录像等，证明双方关系性质（如自愿性、是否存在强迫）。
     
   • 主动配合调查：若被警方介入，应如实陈述事实，避免隐瞒或伪造证据。
     
   • 咨询专业律师：根据具体情节（如女方年龄、双方关系、行为手段等），律师可评估法律风险并制定应对策略。

总结：与16周岁女生发生关系是否犯罪，需结合女方真实年龄、自愿性及男方身份综合判断。若存在强迫、特殊身份或年龄误判等情形，可能面临刑事责任。建议根据实际情况谨慎处理，必要时直接向我咨询具体法律问题。