关于两个孩子做亲子鉴定的费用问题，这并不是一个固定的数值，它会受到多种因素的影响。以下是我从不同角度为你详细分析的情况：

1. 鉴定类型：

   • 司法亲子鉴定：如果鉴定结果需要用于法律诉讼、户籍登记等正式场合，那么通常需要选择司法亲子鉴定。这种鉴定类型需要严格按照法律程序进行，包括身份验证、样本采集、鉴定过程等，因此费用相对较高。一般来说，司法亲子鉴定的费用可能在3000元至5000元不等，具体费用还会因鉴定机构、地区差异以及鉴定项目的复杂程度而有所不同。
   • 个人隐私亲子鉴定：如果鉴定结果仅用于个人了解亲子关系，而不需要用于法律诉讼等正式场合，那么可以选择个人隐私亲子鉴定。这种鉴定类型相对灵活，费用也相对较低。一般来说，个人隐私亲子鉴定的费用可能在2000元至3000元之间，但同样会受到鉴定机构、地区差异等因素的影响。

2. 鉴定机构：

   • 不同的鉴定机构在收费标准上可能存在差异。一些知名的、具有权威性的鉴定机构可能会收取较高的费用，而一些普通的鉴定机构则可能收费较低。因此，在选择鉴定机构时，除了考虑费用因素外，还需要考虑机构的信誉度、专业水平以及服务质量等。

3. 地区差异：

   • 不同地区的经济发展水平、消费水平以及司法环境等因素都可能影响亲子鉴定的费用。一般来说，一线城市或经济发达地区的鉴定费用可能会相对较高，而二三线城市或经济欠发达地区的鉴定费用则可能相对较低。

4. 鉴定项目的复杂程度：

   • 如果鉴定项目涉及多个样本、多个鉴定点或者需要特殊的鉴定技术，那么费用可能会相应增加。例如，如果需要对两个孩子与多个可能的父亲进行亲子鉴定，那么费用就会比简单的父子或母子亲子鉴定要高。

建议：

• 在选择亲子鉴定机构时，不要仅仅以费用为唯一标准，还需要考虑机构的信誉度、专业水平以及服务质量等因素。
• 如果需要进行司法亲子鉴定，建议提前了解当地司法部门或相关机构对亲子鉴定的具体要求和流程，以便更好地准备和配合鉴定工作。
• 如果对亲子鉴定的费用有疑问或需要更详细的信息，可以直接向鉴定机构咨询或向我提问，我会根据你的具体情况为你提供更准确的解答和建议。