关于医院进行臭氧治疗是否合法的问题，这主要取决于医院是否按照相关规定和操作指南来使用臭氧治疗仪。

首先，从法律和监管的角度来看，医疗机构及其医务人员在使用医疗器械，包括臭氧治疗仪时，必须严格遵守《医疗器械临床使用管理办法》等相关规定。这些规定明确了医疗器械的使用范围、禁忌症、注意事项以及主要风险和关键性能指标等，旨在确保医疗活动的安全性和有效性。

具体来说，如果医院在超医疗器械使用范围的情况下使用臭氧治疗仪，比如为患者治疗脑血管疾病（如公主岭市中心医院曾因超范围使用臭氧治疗仪被处罚的案例所示），这就违反了相关规定，可能会受到卫生健康主管部门的行政处罚，包括警告、罚款等。

然而，如果医院在合法的医疗范围内，按照诊疗规范、操作指南以及医疗器械使用说明书等要求，正确使用臭氧治疗仪进行相应的治疗，那么这种行为就是合法的。臭氧治疗本身在医学领域有一定的应用，但必须在专业医生的指导下，确保治疗的安全性和有效性。

此外，值得注意的是，国家卫生健康委等部门也开展过打击非法医疗美容服务专项整治工作，这进一步强调了医疗活动的合法性和规范性。虽然这一专项整治工作主要针对的是医疗美容服务，但也反映了国家对医疗活动整体监管的严格态度。

综上所述，医院进行臭氧治疗是否合法，关键在于是否按照相关规定和操作指南来使用臭氧治疗仪。如果医院能够严格遵守相关规定，确保治疗的安全性和有效性，那么这种行为就是合法的。反之，如果医院违反了相关规定，就可能会受到相应的行政处罚。因此，患者在选择医院和治疗方式时，也应该了解医院是否具备相应的资质和条件，以确保自身的权益和安全。