当法院调解时被告不同意，案件通常会继续进入正式的诉讼程序。以下是对这一问题的详细分析：

一、调解的性质与目的

调解是法院在审理案件过程中，为了促使双方当事人达成和解，减少诉讼成本，提高诉讼效率而采取的一种非诉讼解决纠纷的方式。调解的成功依赖于双方当事人的自愿和协商一致。如果被告不同意调解方案，那么调解就无法达成，案件将按照法定程序继续审理。

二、被告不同意调解的后果

1. 案件继续审理：当被告不同意调解时，法院会结束调解程序，并安排案件进入正式的庭审阶段。在庭审中，双方当事人将有机会陈述自己的观点和证据，法院将根据事实和法律作出判决。

2. 判决结果的不确定性：由于调解未达成，案件将由法院根据事实和法律进行裁决。这意味着判决结果将不再受双方当事人协商的影响，而是由法院独立作出。因此，判决结果可能对原告或被告更为有利，也可能双方都不完全满意。

三、被告不同意调解时的应对策略

1. 准备庭审材料：既然案件将进入庭审阶段，双方当事人都需要积极准备庭审材料，包括证据、证人证言等，以支持自己的主张。

2. 考虑和解可能性：尽管被告在调解阶段不同意调解方案，但在庭审前或庭审过程中，双方仍有可能通过协商达成和解。因此，被告可以考虑在庭审前再次与原告进行沟通，探讨和解的可能性。

3. 尊重法院判决：如果案件最终经过庭审并作出判决，双方当事人都应尊重法院的判决结果。如果对判决结果有异议，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。

四、法律建议

1. 保持冷静与理性：在调解或庭审过程中，双方当事人都应保持冷静与理性，避免情绪化行为影响案件的审理和判决。

2. 积极寻求法律帮助：如果被告对法律程序或案件处理有疑问，可以积极寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。

3. 遵守法律程序：无论案件结果如何，双方当事人都应遵守法律程序，不得采取非法手段干扰案件的审理和判决。

总结来说，当法院调解时被告不同意，案件将进入正式的诉讼程序。被告应积极准备庭审材料，考虑和解可能性，并尊重法院的判决结果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。