关于公司健康问卷调查是否合法的问题，这主要取决于该调查的具体实施情况和相关法律法规的遵循程度。

首先，我们需要明确的是，政府或相关机构开展的统计调查项目，必须依法经过审批或备案。根据《中华人民共和国统计法》的规定，统计调查表应当标明表号、制定机关、批准或者备案文号、有效期限等标志。如果一份健康问卷调查表未标明这些必要的标志，或者超过了其有效期限，那么这份调查表就是非法的，统计调查对象有权拒绝填报。

对于公司自行组织的健康问卷调查，其合法性则主要取决于调查的目的、内容、方式以及是否侵犯了员工的隐私权等合法权益。如果公司是为了了解员工的健康状况，以便更好地提供健康管理和福利服务，且调查内容合法、方式合理，没有侵犯员工的隐私权，那么这样的调查通常是合法的。

然而，如果公司以健康调查为名，行其他不正当目的之实，比如收集员工的个人信息用于非法用途，或者调查内容涉及员工的敏感隐私且未经员工同意，那么这样的调查就是非法的，员工有权拒绝参与，并可以向相关部门进行举报。

此外，任何单位和个人都有权对统计中的弄虚作假等违法行为进行检举。如果员工发现公司的健康问卷调查存在违法行为，可以向县级以上人民政府统计机构进行举报，统计机构会依法受理、核实、处理举报，并为举报人保密。

以平度市卫生健康局开展的涉企行政执法问卷调查为例，这是一个合法的调查活动，因为它是由政府机构组织的，且目的是为了规范涉企行政执法行为，优化营商环境。这样的调查活动通常会遵循相关的法律法规，确保调查的合法性和合规性。

综上所述，公司健康问卷调查的合法性取决于多个因素，包括调查的组织者、目的、内容、方式以及是否遵循了相关的法律法规。如果公司组织的健康问卷调查合法合规，且得到了员工的同意和支持，那么这样的调查就是合法的。如果存在违法行为或侵犯了员工的合法权益，那么员工有权拒绝参与并举报。