结论：与已满16周岁不满18周岁的未成年人发生性关系，是否构成强奸罪，关键在于是否违反了该未成年人的意愿，以及是否使用了暴力、胁迫或其他手段。若违反其意愿并使用了不当手段，则构成强奸罪；若双方自愿且未使用不当手段，则一般不构成强奸罪，但可能涉及其他法律问题。
详细分析：
刑事责任年龄与强奸罪的认定：
- 已满16周岁的人，在法律上被视为具有完全刑事责任能力，即能够对自己的行为承担法律责任。因此，如果与已满16周岁不满18周岁的未成年人发生性关系，且违反了该未成年人的意愿，使用了暴力、胁迫或其他手段，那么行为人将构成强奸罪。
- 需要注意的是，即使该未成年人已满16周岁，但由于其仍属于未成年人范畴，法律在量刑时可能会考虑其年龄因素，从轻或减轻处罚。但这并不意味着可以逃避法律责任，只是量刑上的考量。
自愿性原则在强奸罪认定中的重要性：
- 强奸罪的核心在于是否违反了被害人的意愿。如果双方发生性关系时，该未成年人是自愿的，且没有受到任何强迫、威胁或暴力等手段的影响，那么行为人一般不构成强奸罪。
- 然而，自愿性并不意味着可以忽视其他法律因素。例如，如果行为人利用该未成年人的无知、轻信或经济依赖等关系，诱使其发生性关系，即使表面上看起来是自愿的，也可能构成其他犯罪，如利用职权、从属关系等进行的性侵犯。
其他考量因素：
- 除了年龄和自愿性外，法院在认定强奸罪时还会考虑其他因素，如行为手段是否恶劣、是否造成严重后果等。这些因素都可能影响量刑的轻重。
- 例如，如果行为人使用了特别残忍的手段或造成了该未成年人身体上的严重伤害，那么法院在量刑时可能会更加严厉。
法律建议：
- 对于行为人而言，应当尊重未成年人的意愿和权益，避免与其发生不适当的性关系。如果确实发生了性关系，且存在任何疑问或争议，应立即咨询专业律师以获取法律帮助。
- 对于未成年人及其家长而言，应当加强对未成年人的性教育和保护意识。如果未成年人遭受了性侵犯或疑似性侵犯，应立即报警并寻求法律援助。
可能法律后果：
- 如果行为人构成强奸罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、无期徒刑甚至死刑（在极端情况下）。同时，还可能面临民事赔偿等法律责任。
- 如果行为人不构成强奸罪，但涉及其他违法行为或不当行为，也可能面临相应的法律后果和道德谴责。
总结与提醒：
与已满16周岁不满18周岁的未成年人发生性关系是一个复杂而敏感的问题。在处理此类案件时，应严格遵循法律规定和司法实践中的指导原则，确保公正、合理地处理每一起案件。如果您对此类问题有疑问或担忧，请直接向我咨询以获取准确的法律意见和帮助。