便利店偷窃金额达到多少会被立案，这主要取决于盗窃金额以及是否存在特殊情形，具体分析如下：

1. 一般立案标准：

   • 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理盗窃刑事案件适用法律若干问题的解释》，盗窃公私财物价值一千元至三千元以上、三万元至十万元以上、三十万元至五十万元以上的，应当分别认定为“数额较大”“数额巨大”“数额特别巨大”。通常情况下，盗窃金额达到一千元至三千元以上，公安机关会予以立案追诉。
   • 地区差异：各省级高级人民法院、人民检察院可以根据本地区经济发展状况和社会治安状况，在前款规定的数额幅度内，确定本地区执行的具体数额标准，并报最高人民法院、最高人民检察院批准。例如，在经济较为发达的地区，立案标准可能相对较高，而在经济相对落后地区，立案标准可能相对较低。因此，在具体司法实践中，需以犯罪行为发生地的标准来判断是否达到立案金额。

2. 特殊立案情形：

   • 即便盗窃金额未达到上述“数额较大”标准，如果存在以下特殊情形之一，也应当立案：
     • 多次盗窃：2年内盗窃3次以上即视为“多次盗窃”。如店员在2年内多次窃取店内财物，即便每次金额未达“数额较大”标准，也将被立案。
     • 入户盗窃：非法进入供他人家庭生活的住所进行盗窃，即使金额不大，也构成入户盗窃。若店员进入与店铺相连且用于家庭生活的房间内盗窃，即属于此情形。
     • 携带凶器盗窃：携带枪支、爆炸物、管制刀具等凶器盗窃，无论是否使用，均构成携带凶器盗窃。店员为实施盗窃携带匕首等凶器，即属此类。
     • 扒窃：在公共场所或公共交通工具上盗窃他人随身携带的财物，无论金额大小，均视为扒窃。店员在商场等公共场所窃取顾客随身财物，即构成扒窃。
     • 其他特殊情形：如曾因盗窃受过刑事处罚或一年内曾因盗窃受过行政处罚的；组织、控制未成年人盗窃的；在特定时期和地点盗窃（如自然灾害、事故灾害等突发事件期间，在事件发生地盗窃）；盗窃特定对象财物（如盗窃残疾人、孤寡老人、丧失劳动能力人的财物，或在医院盗窃病人及其亲友财物）；盗窃救灾、抢险、防汛等特定款物的；因盗窃造成严重后果的等。

3. 未达到立案标准的处理：

   • 即使偷窃的财物价值未达到当地规定的立案标准，其行为仍属于违反治安管理的行为。公安机关将依据《中华人民共和国治安管理处罚法》给予行政拘留、罚款等处罚。
   • 同时，便利店有权要求偷窃者承担民事责任，赔偿因其偷窃行为造成的损失。

建议措施：

• 作为便利店店主或管理者，一旦发现偷窃行为，应立即向当地警方报案，并提供相关证据以便进行调查和追诉。
• 在日常经营中，应加强对店铺的安全管理，如安装监控设备、加强员工培训等，以防范偷窃行为的发生。

总结：便利店偷窃金额达到多少会被立案，并没有一个固定的标准，而是取决于盗窃金额、特殊盗窃情形以及地区经济发展水平和社会治安状况。因此，在实际操作中，应依据当地的具体规定和案件的特殊情况来综合判断。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。