结论：超市员工离职时被扣500元是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、若扣款无合法依据，则违法

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
   • 《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条也规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，并有权要求用人单位支付经济补偿。

2. 分析：

   • 如果超市扣款500元没有合法的依据，如未经员工同意、未按照劳动合同或公司规章制度执行，或者扣款理由不合法（如以罚款、赔偿等名义随意扣款），则这种行为是违法的。
   • 员工有权要求超市返还被扣的工资，并可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

二、若扣款有合法依据，则可能合法

1. 合法依据：

   • 如果超市与员工在劳动合同中明确约定了离职时需要扣除一定费用（如培训费、违约金等），并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么超市在员工离职时扣除相应费用可能是合法的。
   • 另外，如果员工因个人原因给超市造成了经济损失，超市在按照劳动合同或公司规章制度的规定，经过合法程序（如告知员工、听取员工意见等）后，扣除一定金额作为赔偿，也是合法的。

2. 分析：

   • 在这种情况下，超市扣款500元需要有明确的合同依据或规章制度支持，并且需要确保扣款金额合理、程序合法。
   • 如果超市能够提供充分的证据证明扣款的合法性和合理性，那么员工可能需要接受这一扣款决定。但即便如此，员工也有权对扣款金额和程序提出异议，并通过合法途径进行维权。

三、特殊情况下的扣款

• 如果员工离职时存在未结清的借款、预支款项等，超市在扣除相应金额后，应将剩余工资支付给员工。这种情况下，扣款是合法的，但需要确保扣款金额准确无误，并且已经与员工进行了充分沟通。

建议：

• 对于员工而言，如果离职时被扣款，应首先了解扣款的原因和依据。如果认为扣款不合法或不合理，可以向超市提出异议，并要求提供扣款的合法证明。
• 如果超市无法提供合法证明或拒绝返还被扣工资，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 对于超市而言，应确保扣款行为有合法依据，并且程序合法、金额合理。在扣款前，应与员工进行充分沟通，并告知扣款的原因和依据。

最后，劳动法律问题往往涉及复杂的法律关系和事实认定，因此在实际操作中，建议员工和超市都咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到妥善维护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。