非法在工业用地上建房的处罚需根据具体违法情形确定，主要包括行政处罚、民事赔偿及刑事责任三种类型，具体如下：

1. 行政处罚
   根据《土地管理法》第七十七条、第七十八条及《城乡规划法》第六十四条，非法占用工业用地建房可能面临：

   • 限期拆除：若建房行为违反土地利用总体规划或城乡规划，自然资源部门可责令限期拆除房屋，恢复土地原状；
     
   • 没收违法所得：对非法转让土地使用权或建房后出租、出售的，可能没收违法所得；
     
   • 罚款：按非法占用土地面积处每平方米100元至1000元罚款（具体标准由地方规定）；
     
   • 责令退还土地：若占用土地属于集体所有，需退还土地至原集体经济组织。

2. 民事赔偿

   • 若建房行为损害相邻方合法权益（如采光、通风、排水等），需承担停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等民事责任；
     
   • 若土地原使用权人因非法建房遭受损失（如土地价值贬损），可要求侵权人赔偿。

3. 刑事责任
   若建房行为符合以下情形，可能构成犯罪：

   • 非法占用农用地罪（《刑法》第三百四十二条）：若工业用地属于农用地（如耕地、林地），且非法占用面积达到5亩以上或基本农田3亩以上，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；
     
   • 非法转让、倒卖土地使用权罪（《刑法》第二百二十八条）：若以牟利为目的非法转让土地使用权，情节严重的，处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

实务建议：

1. 若已实施建房行为，建议立即停止并委托律师评估土地性质、规划合规性及行政处罚风险；
   
2. 若面临处罚，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，主张程序违法或事实认定错误；
   
3. 若涉及刑事风险，需尽快委托律师介入，争取从轻情节（如自首、立功、退赃等）。
   

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我将结合地方性法规及司法实践提供针对性分析。