关于“法院跟部队有关系怎么处理”这一问题，核心在于明确“关系”的具体性质，再结合法律和政策规定来处理。以下是不同情况的分析与处理建议：

1. 若“关系”指法院与部队存在业务协作或司法协助
   法院与部队在涉及军事案件、军人权益保护等场景中，可能存在协作关系（如军事法院与地方法院的案件管辖衔接）。此类关系受《军事司法协助条例》等法规规范，需确保程序合法、权限清晰。若您遇到此类协作中的具体问题（如管辖争议、证据调取等），可直接向我说明细节，我会结合具体法规分析处理方式。

2. 若“关系”指部队人员或单位涉及民事/刑事诉讼
   部队人员或单位作为诉讼主体时，法院需依法独立行使审判权，不受部队干预。根据《民事诉讼法》《刑事诉讼法》，军人或军事单位参与诉讼时，法院会按普通程序审理，但涉及军事秘密的案件可能适用特殊程序（如不公开审理）。若您是部队人员或相关方，需注意诉讼权利义务与普通公民一致，但可申请军事律师协助。

3. 若“关系”指部队干预法院审判或执行
   若发现部队以行政权力干预司法（如要求法院偏袒某方），这属于违法行为。根据《宪法》第131条，法院独立行使审判权，任何行政机关、社会团体和个人不得干涉。您可向上一级法院或纪检监察机关举报，并保留证据（如书面指令、录音等）。若您是当事人，建议同步委托律师介入，通过法律程序维护权益。

4. 若“关系”指法院执行涉及部队财产或人员
   法院执行时若涉及部队资产（如军产房、军事设施）或现役军人，需遵循《军事设施保护法》《军队房地产管理条例》等规定。例如，军产房一般不得强制执行，现役军人工资可能需保留基本生活费用。若您是执行申请人或被执行方，需提前评估财产性质，避免程序违法。

总结建议：

• 明确“关系”具体类型（协作/诉讼/干预/执行），这是处理问题的关键；
  
• 保留相关证据（如文件、沟通记录），便于后续维权；
  
• 根据场景选择对应法律途径（如申诉、举报、申请特殊程序）。
  

若有具体案例或细节，可直接向我说明，我会进一步分析并提供操作方案。