分公司注销后，若总公司仍在，劳动者仍然可以申请劳动仲裁。以下是对此问题的详细分析：
一、分公司与总公司的法律关系
分公司的法律地位：分公司是总公司的分支机构，它不具有独立的法人资格。这意味着分公司无法独立承担民事责任，其民事责任由总公司承担。
劳动关系的延续性：尽管分公司已注销，但劳动者与总公司之间的劳动关系并未因此终止（除非双方另有约定或已合法解除）。劳动者在分公司工作期间产生的劳动争议，仍应视为与总公司的争议。
二、劳动仲裁的适用范围与条件
劳动仲裁的适用范围：劳动仲裁是解决用人单位与劳动者之间劳动争议的重要途径。只要存在劳动争议，且符合劳动仲裁的受理条件，劳动者就可以申请劳动仲裁。
申请劳动仲裁的条件：
- 存在劳动争议：如未支付的工资、经济补偿金、社保等争议。
- 在规定时效内提出：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年仲裁时效期间的限制；但劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
三、申请劳动仲裁的步骤与注意事项
准备材料：
- 收集并整理与劳动争议相关的证据材料，如劳动合同、工资单、考勤记录等。
- 撰写劳动仲裁申请书，明确申请人的基本信息、被申请人的基本信息（此处应为总公司）、仲裁请求及事实和理由等。
提交申请：
- 将准备好的材料和申请书提交给当地劳动争议仲裁委员会。
- 注意提交申请的时效要求，确保在规定时间内提出。
参与仲裁程序：
- 按照仲裁委员会的安排，参与仲裁庭审过程。
- 在庭审中充分陈述自己的观点和理由，并提供相关证据支持自己的主张。
等待裁决结果：
- 仲裁委员会将根据事实和法律规定作出裁决。
- 如对裁决结果不满意，可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
四、特殊情况处理
- 若分公司注销前未依法清算：若分公司注销前未依法进行清算，导致劳动者权益受损，劳动者除可向总公司追责外，还可根据具体情况向相关责任人（如清算组成员、股东等）追责。
- 若总公司也面临注销或破产：在这种情况下，劳动者的权益保护将更为复杂。劳动者应密切关注总公司的动态，并在必要时及时采取法律措施维护自己的权益。
总结与建议：分公司注销后，若总公司仍在，劳动者仍然可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁前，劳动者应仔细了解相关法律法规和实际情况，并准备好相应的证据材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。