结论：一般情况下，还款当天自动扣款失败后自己手动还款不算逾期，但具体是否构成逾期需结合合同约定、还款时间、银行处理规则等因素综合判断。以下是详细分析：

1. 合同约定优先
   需首先查看借款合同或相关协议中关于“还款方式”“逾期认定”的条款。若合同明确约定“仅以自动扣款结果为准”，或规定“手动还款需提前X小时操作”，则可能因未满足条件被认定为逾期；若合同未限制还款方式（如允许手动还款），则及时手动还款通常不构成逾期。

2. 还款时间节点是关键

   • 宽限期规则：部分金融机构提供还款宽限期（如1-3天），若手动还款在宽限期内完成，即使自动扣款失败，也不视为逾期。
     
   • 到账时间：需确认手动还款的到账时间。若在还款日24:00前到账（或合同约定的截止时间前），通常不算逾期；若因银行处理延迟导致次日到账，可能需提供还款凭证（如转账记录）与金融机构协商免除逾期责任。

3. 操作主动性与证据留存

   • 主动还款行为：自动扣款失败后，借款人主动手动还款，体现了还款意愿，金融机构通常不会刻意认定为逾期。
     
   • 证据保留：建议保留还款凭证（如银行流水、支付截图），若金融机构误报逾期，可凭证据申诉修正征信记录。

4. 特殊情形提示

   • 信用卡还款：若为信用卡，需注意“容时服务”（宽限期）和“容差服务”（小额未还部分），手动还款需在宽限期内足额还清最低还款额，否则可能产生利息或影响征信。
     
   • 房贷/车贷：部分银行要求还款日当天扣款两次（如上午、下午各一次），若第一次扣款失败，需在第二次扣款前补足，否则可能算逾期。

建议行动：

1. 立即检查合同中关于还款方式、逾期认定的条款；
   
2. 确认手动还款的到账时间，并保留凭证；
   
3. 若金融机构已报送逾期记录，可凭还款凭证联系客服申诉修正。
   

如有进一步疑问（如具体合同条款解读、征信异议处理等），可直接向我咨询。