在行政案件中，若遇到证人拒绝作证的情况，可以按照以下方式处理：

1. 明确证人义务与法律责任
   根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，证人有出庭作证的法定义务。若证人无正当理由拒绝作证，法院可依法采取强制措施，包括训诫、责令具结悔过、罚款（个人10万元以下，单位5万-100万元）或拘留（15日以下）。若构成犯罪（如伪证罪、妨害作证罪），还可能追究刑事责任。

2. 区分“拒绝作证”的具体情形

   • 无正当理由拒绝：如证人仅以“怕麻烦”“不想参与”等主观理由拒绝，法院可直接依据上述强制措施处理。
     
   • 有正当理由拒绝：若证人因生理缺陷、精神障碍、年幼无法表达，或存在法定回避情形（如与案件有利害关系），可免除作证义务。此时需由证人提出书面申请并附证明材料，法院审查后决定是否采纳。
     
   • 特殊职业保护：如律师、医生等因职业保密义务拒绝作证，需结合《律师法》《医师法》等具体规定判断。若保密义务与作证义务冲突，通常以保密义务优先，但涉及重大公共利益或犯罪时可能例外。

3. 法院的应对措施

   • 传唤与拘传：法院可向证人送达《出庭通知书》，若证人拒不到庭，可签发《拘传票》强制到庭（仅适用于必须到庭的证人）。
     
   • 书面证言的审查：若证人虽拒绝出庭但提交书面证言，法院需结合其他证据审查其真实性。若证言与其他证据矛盾且无合理解释，可能不予采信。
     
   • 推定不利后果：在特定情况下（如证人无正当理由拒不到庭且其证言对案件关键事实有重大影响），法院可依据《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》第71条，推定该证言不利于拒绝作证的证人一方（如原告或被告）。

4. 当事人的救济途径

   • 申请法院强制证人到庭：当事人可向法院提交书面申请，说明证人拒不作证的事实及理由，由法院决定是否采取强制措施。
     
   • 补充其他证据：若证人拒证导致关键证据缺失，当事人应尽快收集其他证据（如物证、书证、视听资料等）形成证据链，以支持己方主张。
     
   • 对证言真实性提出质疑：若对方依赖拒证证人的书面证言，当事人可通过交叉询问、申请鉴定等方式质疑其真实性，降低法院采信概率。

总结：证人拒绝作证时，法院可通过强制措施、审查书面证言或推定不利后果等方式处理；当事人应积极申请法院介入，并补充其他证据以维护自身权益。具体操作需结合案件细节和证据规则，建议根据实际情况进一步咨询。