工程仲裁和诉讼在解决建设工程纠纷时存在多方面的区别，主要体现在以下几个方面：

1. 解决机制与程序：

   • 仲裁：仲裁是一种非诉讼的纠纷解决方式，它依赖于双方当事人在合同中约定的仲裁条款或事后达成的仲裁协议，将纠纷提交给仲裁机构进行裁决。仲裁程序相对灵活，通常包括申请、受理、组成仲裁庭、开庭审理、裁决等步骤，且仲裁庭的组成、审理方式等都可以由当事人协商确定。仲裁裁决具有终局性，对双方当事人均有约束力，除非存在法定撤销情形，否则不得向法院提起上诉。
   • 诉讼：诉讼则是通过法院系统来解决纠纷的方式。当事人向法院提起诉讼后，法院会依法受理并组成合议庭进行审理。诉讼程序相对严格，包括起诉、受理、审理前准备、开庭审理、判决等阶段，且必须遵循法定的诉讼程序和规则。诉讼判决具有强制执行力，但当事人对一审判决不服的，可以在法定期限内提起上诉，进入二审程序。

2. 专业性与效率：

   • 仲裁：仲裁机构通常拥有专业的仲裁员队伍，这些仲裁员往往具有丰富的行业经验和专业知识，能够更准确地理解和处理建设工程领域的复杂纠纷。此外，仲裁程序相对灵活，可以更快地安排开庭和裁决，因此效率较高。
   • 诉讼：虽然法院也拥有专业的法官队伍，但诉讼程序相对繁琐，需要遵循严格的法定程序和规则，因此可能耗时较长。特别是在建设工程纠纷中，由于涉及的技术和法律问题复杂，诉讼过程可能更加漫长。

3. 保密性与公开性：

   • 仲裁：仲裁程序通常具有保密性，仲裁庭的审理和裁决过程不对外公开，这有助于保护当事人的商业秘密和隐私。
   • 诉讼：诉讼程序则具有公开性，法院的审理和判决过程通常对外公开，除非涉及国家秘密、个人隐私或商业秘密等特殊情况。

4. 执行与救济：

   • 仲裁：仲裁裁决具有终局性，一旦作出即对双方当事人产生约束力。如果一方不履行仲裁裁决，另一方可以向法院申请强制执行。同时，在特定情况下，当事人还可以向法院申请撤销仲裁裁决。
   • 诉讼：诉讼判决同样具有强制执行力。如果一方不履行诉讼判决，另一方可以向法院申请强制执行。此外，当事人对一审判决不服的，还可以在法定期限内提起上诉，进入二审程序寻求救济。

针对您的情况，我建议：

• 如果您希望纠纷解决过程更加灵活、高效且保密，且双方当事人在合同中已经约定了仲裁条款或事后达成了仲裁协议，那么选择仲裁可能是一个更好的选择。
• 如果您希望纠纷解决过程更加公开、透明，且希望获得法院的强制执行保障，或者对仲裁裁决的终局性存在疑虑，那么选择诉讼可能更为合适。

最后，无论您选择仲裁还是诉讼来解决建设工程纠纷，都需要确保您的权益得到充分保护。如果您在具体操作过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。