结论：公司以不值班为由扣绩效是否合法需分情况讨论，若值班并非劳动合同或规章制度明确约定内容，公司扣绩效不合法；若值班是约定内容且员工无正当理由拒绝，公司扣绩效可能合法，但需符合一定条件。以下为详细分析：

值班是否为劳动合同或规章制度明确约定内容

1. 若值班并非劳动合同或规章制度明确约定内容
   • 公司行为不合法：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条规定，依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。同时，公司的规章制度要合法有效，需经过民主程序制定（如与职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定等），并且向劳动者公示告知。如果值班并没有在劳动合同或者经过合法程序制定的规章制度中明确规定，那么公司以不值班为由扣除绩效工资就缺乏合法依据。
   • 员工应对措施：员工可以首先与公司进行友好协商，向公司说明情况，指出公司扣除绩效工资的行为没有合法依据，要求公司补发被扣除的绩效工资。如果协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对公司的违法行为进行调查处理，责令公司改正并补发工资。此外，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
2. 若值班是劳动合同或规章制度明确约定内容
   • 员工无正当理由拒绝值班
     • 公司扣绩效可能合法，但需符合一定条件：在这种情况下，员工有义务按照约定进行值班。如果员工无正当理由拒绝值班，公司可以依据劳动合同或规章制度的规定对员工进行一定的处理，包括扣除绩效工资。但是，公司扣除绩效工资的比例和金额需要合理，不能违反法律法规的强制性规定。例如，扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。同时，公司扣除绩效工资的规章制度应当明确具体的扣除标准和程序，并且已经向员工公示告知。
     • 员工应对措施：如果员工认为公司扣除绩效工资的比例或金额不合理，或者公司的规章制度存在违法违规的情况，员工可以与公司进行沟通协商，要求公司重新审核扣除绩效工资的决定。如果协商无果，员工同样可以向劳动监察部门投诉或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司返还不合理扣除的绩效工资。
   • 员工有正当理由拒绝值班
     • 公司扣绩效不合法：如果员工有合理的理由拒绝值班，比如因生病需要休息、家中有紧急情况需要处理等，并且能够提供相应的证明材料，那么公司以不值班为由扣除绩效工资就是不合理的。在这种情况下，员工有权要求公司补发被扣除的绩效工资。
     • 员工应对措施：员工应及时向公司提供相关证明材料，说明自己拒绝值班的正当理由，与公司协商补发绩效工资。如果公司拒绝补发，员工可以通过向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等方式来维护自己的权益。