结论前置：自离时公司扣一半工资的行为，通常是不合法的。员工自离前已经实际提供了劳动的，用人单位应当支付相应的劳动报酬；若因自离给单位造成经济损失，用人单位可依法要求赔偿，但赔偿金额需合理，且扣除部分有严格限制。
一、法律依据与基本原则
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《工资支付暂行规定》也明确指出，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
劳动合同解除规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日（或在试用期内提前三日）以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。若劳动者未按规定提前通知而自离，即构成违法解除劳动合同，但违法解除并不意味着用人单位可以随意克扣工资。
二、自离时工资的支付与扣除
已提供劳动部分的工资支付：
- 劳动者自离前已经实际提供了劳动的，用人单位应当按照双方约定或公司规定的工资计算方式，支付相应的劳动报酬。例如，员工在本月工作了若干天后自离，用人单位应支付其实际工作天数的工资。
因自离给单位造成损失的赔偿：
- 若劳动者的自离行为给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求劳动者进行赔偿。但赔偿金额的计算应合理，且每月从工资中扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 计算公式（若需计算赔偿金额上限）：赔偿金额上限 = 当月工资 × 20%
- 示例：假设员工当月工资为5000元，因自离给单位造成损失，单位要求赔偿。则每月最多可从工资中扣除1000元（5000元 × 20%）作为赔偿，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
特殊情况：
- 如果劳动者与用人单位签订了竞业限制协议或服务期协议，并且自离行为构成违约，劳动者需要按照协议约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额应当合理，且扣除方式需符合法律规定。
三、维权措施
与公司协商：
- 尝试与人力资源部门或上级领导友好沟通，了解扣工资的具体原因，并要求公司提供明确的依据。明确指出公司扣工资行为不合法，要求纠正并补发工资。
- 技巧：保持礼貌但态度坚定，保留沟通记录作为证据。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉。投诉时需准备身份证、劳动关系证明（如劳动合同、工作证）、克扣工资证据等材料。
- 流程：可通过当面、官网或电话等方式投诉，劳动监察部门将调查处理。
申请劳动仲裁：
- 若投诉未能解决问题，可以选择申请劳动仲裁。向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，包括申请书、证据材料等。仲裁委员会将安排开庭审理，并作出裁决。
- 执行：若公司不履行仲裁裁决，可向法院申请强制执行。
四、注意事项与建议
- 保留证据：在整个维权过程中，务必保留好各类证据，包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录、工作证、与公司沟通的聊天记录、邮件等。这些证据在协商、投诉、仲裁过程中起到关键作用。
- 了解法律规定：熟悉《中华人民共和国劳动法》、《工资支付暂行规定》以及《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，以便更好地维护自己的合法权益。
- 及时行动：注意维权时限，劳动争议申请仲裁的时效期间一般为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
综上所述，自离时公司扣一半工资的行为通常是不合法的。员工应首先尝试与公司协商解决，若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。