运输甲基苯丙胺3克属于严重的毒品犯罪行为，将面临严厉的刑事处罚，具体处理方式如下：

1. 法律定性：甲基苯丙胺（冰毒）是我国《刑法》明确列管的毒品，运输行为直接构成《刑法》第三百四十七条规定的“运输毒品罪”。无论数量多少，均需承担刑事责任。

2. 量刑标准：

   • 根据《刑法》及司法解释，运输甲基苯丙胺不满10克的，依法应处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；
   • 若存在累犯、再犯、武装掩护运输、参与有组织国际贩毒等法定从重情节，可能面临三年以上七年以下有期徒刑；
   • 若运输行为伴随暴力抗拒检查、造成严重后果等情形，量刑可能进一步加重。

3. 关键量刑因素：

   • 毒品纯度：司法实践中可能通过鉴定确定毒品实际含量，但3克甲基苯丙胺通常已达到刑事立案标准；
   • 主观明知：需证明行为人明知运输的是毒品（如通过聊天记录、交易记录等证据）；
   • 犯罪形态：是否完成运输、是否被当场查获等会影响既遂/未遂认定；
   • 立功表现：如协助抓捕其他涉毒人员，可能依法从轻或减轻处罚。

4. 程序流程：

   • 公安机关立案侦查后，可能采取刑事拘留、逮捕等强制措施；
   • 检察机关审查起诉阶段，律师可介入申请取保候审或提出辩护意见；
   • 法院审理阶段，将根据证据链完整性、量刑情节等作出判决。

特别提醒：毒品犯罪案件证据要求严格，建议家属或当事人第一时间委托专业律师介入，通过会见、阅卷、调查取证等方式争取合法权益。若需进一步分析具体案情（如运输方式、是否初犯等），可直接向我提供细节，我将结合司法实践为您详细解答。