核心结论：若卖房协议中有付款金额条款但转账记录缺失，可通过补充证据、协商解决或诉讼途径来维护自身权益，具体如下：

1. 补充收集证据
   • 寻找其他支付凭证：除了转账记录，还可以查找是否有其他能够证明付款事实的证据。比如，如果买方是通过银行汇票、本票等方式支付房款，那么汇票、本票的存根以及相关银行的兑付记录等都可以作为付款的证据；若是现金支付，可尝试寻找在场见证人，让见证人出具书面证言，详细说明付款的时间、地点、金额等关键信息。同时，如果卖方在收到现金后曾向买方出具过收条，收条也是非常重要的直接证据。
   • 收集沟通记录：整理与买方在交易过程中的各种沟通记录，如短信、微信聊天记录、电子邮件等。在这些沟通内容中，买方可能会承认已经支付了房款或者提及付款的相关事宜，这些都可以作为辅助证据来证明付款事实的存在。例如，买方在微信中说“房款已经转给你了，注意查收”，虽然可能没有实际的转账记录与之对应，但结合其他情况，也能在一定程度上证明付款的意图和可能的行为。
2. 与买方协商解决
   • 友好沟通：首先尝试与买方进行友好、坦诚的沟通，了解转账记录缺失的原因。有可能是买方疏忽导致转账记录丢失，或者是转账过程中出现了技术问题，如银行系统故障等。在这种情况下，可以要求买方重新提供转账记录或者由银行出具相关的转账证明。
   • 签订补充协议：如果经过沟通，双方对付款事实没有争议，只是为了确保交易的合法性和安全性，可以签订一份补充协议。在补充协议中明确说明虽然转账记录暂时缺失，但买方确实已经按照卖房协议的约定支付了相应的房款，双方对该事实予以确认，并约定后续的相关事宜，如房产过户的时间、方式等。这样可以避免日后可能出现的纠纷。
3. 通过诉讼途径解决
   • 提起诉讼：如果与买方协商无果，且卖方有足够的证据证明买方未履行付款义务（即使转账记录缺失，但结合其他证据能够形成完整的证据链），卖方可以向法院提起诉讼，要求买方按照卖房协议的约定支付房款，并承担相应的违约责任。在诉讼过程中，卖方需要向法院提交卖房协议以及其他能够证明付款事实的证据，如上述提到的其他支付凭证、沟通记录等。
   • 法院调查取证：如果卖方确实无法自行收集到足够的证据，可以向法院申请调查取证。法院有权根据当事人的申请和案件的需要，向相关银行、金融机构等调取买方的账户交易信息，以查明是否存在付款的事实。同时，法院也会根据双方提供的证据和庭审情况，综合判断买方是否履行了付款义务。

在处理此类问题时，要尽可能收集全面、有效的证据，以支持自己的主张。如果你还有其他疑问或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。