如果发现别人未经您同意，使用您的商铺注册了公司，这确实是一个需要严肃对待的问题。作为商铺的合法所有者，您有权维护自己的权益，以下是一些建议的步骤，帮助您有效应对这一情况：

一、立即报案并收集相关证据

首先，您应尽快向当地的公安机关报案，详细陈述您的商铺被他人盗用注册公司的情况。在报案时，请务必提供以下证据：

• 产权证明：如商铺的产权证书，以证明您对该商铺拥有合法的所有权。
• 身份证明：您的身份证或其他有效证件，以确认您的身份。
• 注册信息证据：通过国家企业信用信息公示系统或当地市场监督管理部门查询并打印出盗用您商铺注册公司的详细信息，包括公司名称、法定代表人、注册地址等。
• 其他相关证据：如您收到的与该公司相关的通知、信件，或与该公司或相关人员就此事沟通的记录（短信、微信聊天记录、邮件等）。

二、尝试与涉事公司沟通

在报案的同时，您可以尝试与涉事公司取得联系，明确告知他们未经您授权使用您的商铺地址进行注册是侵权行为。要求他们立即办理注册地址的变更或注销公司注册地址与您商铺的关联。如果自行沟通效果不佳，您可以考虑委托律师向涉事公司发送律师函，正式告知对方其行为的违法性以及可能面临的法律后果。

三、向市场监督管理部门投诉

若与涉事公司沟通无果，您应向当地的市场监督管理部门（工商行政管理部门）进行投诉。在投诉时，请提交您之前收集的所有证据材料，并详细说明情况。要求市场监督管理部门撤销该公司在您商铺上的注册，并采取相应的措施纠正违法行为。您需要积极配合市场监督管理部门的工作，及时跟进处理进度。

四、考虑法律诉讼

如果市场监督管理部门的处理未能有效解决问题，或者您认为自身权益受到的损害较为严重，您可以考虑向人民法院提起侵权诉讼。在诉讼中，您可以要求涉事公司停止侵权行为，消除因使用您商铺地址注册公司给您造成的不良影响，并赔偿因此给您带来的经济损失。由于法律诉讼较为复杂，建议您聘请专业的律师为您代理案件。

五、保持冷静与耐心，积极维护权益

在整个过程中，保持冷静和耐心非常重要。请积极与相关部门和人员沟通协作，共同推动问题的妥善解决。同时，也要相信法律的力量，通过合法途径来维护自己的权益。

总之，面对商铺被他人盗用注册公司的情况，您应立即采取行动，从报案、收集证据到与涉事公司沟通、向市场监督管理部门投诉，再到考虑法律诉讼，每一步都需谨慎而有序地进行。只有这样，才能有效地保护自己的合法权益不受侵害。