结论：在公司中，若妻子作为法人持有51%的股权，丈夫作为股东持有49%的股权，当妻子希望注销公司而丈夫不同意时，不能直接单方面注销公司。是否能够注销公司，需根据《公司法》的相关规定以及公司章程的具体约定来判断。以下从不同角度进行分析：
公司法规定角度：
- 根据《公司法》的相关规定，公司注销通常需要经过股东会或股东大会的决议。决议的通过往往需要代表一定比例表决权的股东同意。在有限责任公司中，对于公司注销等重大事项，通常需要代表三分之二以上表决权的股东通过。
- 在您描述的情况下，妻子持有51%的股权，丈夫持有49%的股权。若公司章程未对注销公司的表决权比例有特别约定，那么按照《公司法》的一般规定，妻子无法单独达到三分之二以上的表决权比例，因此无法直接通过股东会决议注销公司。
公司章程约定角度：
- 公司章程是公司的重要法律文件，它规定了公司的组织结构、运营方式、股东权利与义务等重要事项。如果公司章程中对注销公司的表决权比例有特别约定，且该约定不违反《公司法》的强制性规定，那么应按照公司章程的约定执行。
- 因此，如果公司章程中约定了注销公司只需代表过半数表决权的股东同意，那么妻子作为持有51%股权的法人，就有权通过股东会决议注销公司。但这种情况较为少见，且需确保公司章程的约定合法有效。
实际操作建议：
- 协商沟通：首先，建议妻子和丈夫进行充分的协商沟通，尝试达成一致意见。如果双方能够就公司注销问题达成共识，那么可以按照协商的结果进行操作。
- 修改公司章程：如果双方无法就注销问题达成一致，但妻子认为注销公司是必要的，可以考虑通过修改公司章程来降低注销公司的表决权比例。然而，这需要得到丈夫的同意，并且修改后的公司章程不得违反《公司法》的强制性规定。
- 寻求法律途径：如果双方无法协商一致，且公司章程中也没有相关约定，那么妻子可能无法直接注销公司。在这种情况下，妻子可以考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼要求解散公司（在符合法定解散条件的情况下）或寻求其他法律救济。但需要注意的是，提起诉讼需要充分的证据和法律依据，并且可能面临一定的法律风险和成本。
后续行动建议：在处理此类问题时，建议妻子和丈夫都保持冷静和理性，通过协商沟通来寻求最佳解决方案。如果协商无果，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的权利和义务，并制定合适的法律策略。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。