合同丢了补签合同本身并不违法，但需根据具体情况判断补签合同的合法性和有效性。以下从不同角度为你详细分析：
一、补签合同的合法性基础
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议，当事人有权自愿订立合同。因此，在原合同丢失的情况下，双方当事人基于自愿原则补签合同，是合法的行为。
合同内容合法性：补签合同的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。如果补签合同的内容合法，且双方当事人意思表示真实，那么该补签合同就是有效的。
二、补签合同可能涉及的法律问题
原合同权利义务的承接：在补签合同时，双方应明确原合同的权利义务是否继续有效，以及补签合同是否对原合同进行了修改或补充。如果补签合同对原合同的权利义务进行了实质性变更，那么应视为双方达成了新的合意，原合同的相关条款可能不再适用。
证据效力问题：虽然补签合同本身不违法，但如果原合同丢失后，双方无法就原合同的内容达成一致，且补签合同的内容与原合同存在实质性差异，那么在发生纠纷时，补签合同的证据效力可能会受到质疑。因此，在补签合同时，建议双方尽可能保留与原合同相关的证据，如交易记录、沟通记录等，以证明补签合同的真实性和合法性。
第三方权益保护：如果原合同的履行涉及第三方的权益，如担保人、债权人等，那么在补签合同时，应确保第三方的权益不受损害。否则，补签合同可能会因损害第三方权益而被认定为无效。
三、补签合同的建议
明确补签目的和内容：在补签合同前，双方应明确补签的目的和内容，确保补签合同能够真实反映双方的意思表示和原合同的权利义务关系。
保留相关证据：如前所述，保留与原合同相关的证据对于证明补签合同的真实性和合法性至关重要。因此，在补签合同时，建议双方尽可能收集并保留相关证据。
咨询专业律师：虽然补签合同本身不违法，但涉及复杂的法律问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况为你提供专业的法律建议和指导，确保补签合同的合法性和有效性。
总结来说，合同丢了补签合同本身并不违法，但需根据具体情况判断补签合同的合法性和有效性。在补签合同时，建议双方明确补签目的和内容、保留相关证据，并在涉及复杂法律问题时咨询专业律师的意见。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。